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多示例学习不懂的地方

一个分子可以有多个low-engergy shape,但是在当时学者们只能判断一个分子能否制成药物,而不能判断到底是分子的哪个low-energy shape在起作用。假如我们用常见的分类算法,把所有能制药的分子的low-energy shape当作正例,反之当作负例。那么我们的训练结果会非常不准确,因为我们有太多的

免疫系统也有物联网?新技术首次看到免疫细胞如何协调行动

九游会首页登录·J9九游会·welcome!这种高通量分析技术,使我们首次看到了人体免疫细胞之间是如何通过符合物理定律的方式进行集体性协调行动。 阐明人体免疫系统内在的细胞物理性连接机制,具有非常重要的临床研究与应用价值,可以推动感染、恶性肿瘤和自身免疫性疾病等等许多免疫相

学习笔记256—主要区别– mRNA tRNA与rRNA

什么是mRNA    信使RNA(mRNA)分子携带从核到核糖体的基因转录本,该基因编码特定的功能蛋白。 mRNA的产生通过称为转录的过程发生。 参与转录的酶是RNA聚合酶。 在真核生物中,前mRNA分子通过转录后修饰加工成成熟的RNA分子。 mRNA的前处理包括5'帽的添加,编辑和聚腺苷酸化。 在5'端的

奇怪的分式

题目: 上小学的时候,小明经常自己发明新算法。一次,老师出的题目是:1/4​乘以8/5 小明居然把分子拼接在一起,分母拼接在一起,答案是: 18/45 老师刚想批评他,转念一想,这个答案凑巧也对啊,真是见鬼! 对于分子、分母都是 1 ~ 9 中的一位数的情况,还有哪些算式可以这样计算呢? 请写出所有不同算

还在为课题设计烦恼、秃头。教你一招,一次性解决

  关注公众号:Sci科研助力 筛和猜,你pick哪一个? 常言道,万变不离其宗,科研亦如此,无论其外在形式如何复杂多变,其内在的逻辑论证规律始终不变,而这便是基础科研中所谓的套路。 然而,科研中的套路既来源于文献又高于文献,零基础科研者们如若不经过一番摸爬滚打,只怕很难真正领悟其中奥义

分子动力模拟

摩尔气体常数 molar gas constant R=0.008314472kJ/ (mol·K)           分子模拟中使用基于牛顿力学的力场(Force Field)来描述分子内于分子间作用力。一般为以下函数形式: 其中前一项为L-J势(短程力),是用来模拟两个电中性的分子或

陶瓷膜提升小分子肽在未来市场上的广阔前景

  许多人都会不解,概念中的小分子肽是什么?为什么有如此多的用处?其实介于氨基酸与蛋白质之间一种生化物质,是一个蛋白质的片段。21世纪为人类营养成分做出较大贡献,小分子肽具有较强的活性和多样性,已成为当今生物学、医学、药学等领域研究与开发的热点,受到现代生物学界的高度重

CADD药物设计+CIDD人工智能药物筛选+蛋白-分子动力学

计算机辅助药物设计(CADD)是以量子力学和分子力学的分子模拟理论为基础,通过模拟、计算或模型学习,预测药物与靶标分子之间的作用,筛选、设计和优化先导化合物的方法。而在此次新冠肺炎疫情中,计算机辅助药物设计也为抗病毒药物研发,贡献上关键的力量。CADD的优势:提高药物设计命中率、

AIDD人工智能药物发现与设计+CADD计算机辅助药物设计专题+蛋白-分子对接虚拟筛选Amber分子动力学专题

专题课程一:CADD计算机辅助药物设计药物研发专题 专题课程二:AIDD人工智能药物虚拟筛选与毒性预测专题 专题课程三:蛋白-分子对接虚拟筛选Amber分子动力学专题 计算机辅助药物设计(CADD)是以量子力学和分子力学的分子模拟理论为基础,通过模拟、计算或模型学习,预测药物与靶标分子之间的

AIDD人工智能药物发现与设计+CADD计算机辅助药物设计

专题课程一:CADD计算机辅助药设计药物研发专题培训班 专题课程二:AIDD人工智能药物虚拟筛选与毒性预测专题培训班 专题课程三:蛋白-分子对接虚拟筛选Amber分子动力学专题培训班 培训背景 计算机辅助药物设计(CADD)是以量子力学和分子力学的分子模拟理论为基础,通过模拟、计算或模型学

药物设计常用方法分子对接方法

一:概述 分子对接是指两个或多个分子通过几何匹配和能量匹配相互识别的过程,在药物设计中有十分重要的意义。药物分子在产生药效的过程中,需要与靶酶相互结合,这就要求两个分子要充分接近并采取合适的取向以使二者在必要的部位相互契合,发生相互作用,继而通过适当的构象调整,得到一

遇到一道有意思的题目,在此分享一下

约分最简分式 分数可以表示为分子/分母的形式。编写一个程序,要求用户输入一个分数,然后将其约分为最简分式。最简分式是指分子和分母不具有可以约分的成分了。如6/12可以被约分为1/2。当分子大于分母时,不需要表达为整数又分数的形式,即11/8还是11/8;而当分子分母相等时,仍然表达为1/

第二章---分子振动与近红外光谱

        近红外光谱的化学信息是分析过程样品分子振动量子状态跃迁信息在光谱的加载。 1. 分子中原子之间的振动与振动光谱         分子中原子之间的振动简称分子的振动。我们知道,分子中原子依靠化学键进行互相结合,这种原子间的键合存在一个能量等级最低的平衡位置,想象

晶格动力学程序 GULP

大家好,我是木南 分子动力学软件诸多,包括: 1. LAMMPS LAMMPS即Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator,可以翻译为大规模原子分子并行模拟器,主要用于分子动力学相关的一些计算和模拟工作,一般来讲,分子动力学所涉及到的领域,LAMMPS代码也都涉及到了。LAMMPS可以

学长毕业日记 :本科毕业论文写成博士论文的神操作20170331

20170331工作总结:今天计算了分子的态密度,也优化了一些分子的结构。另外自己开发了两个个机器人“小小度”和“小阳阳”,通过我的机器学习后,更加聪明了,增加了好多好多功能模块。通过不断地训练,不断地进行测试和优化,会变得更加厉害,希望他有一天像小度一样,打败最强大脑。有时候自己

计算机基础

计算机基础     计算机是一切IT工作的基础,没有计算机我们就没有了工具与目的,所以我们这篇文章就来介绍一下计算机基础的东西 计算机就是电脑       定义:计算机(computer)俗称电脑,是现代一种用于高速计算的电子计算机器,可以进行数值计算,又可以进行逻辑计算,还具有存储记忆功能

结对项目

结对项目 软件工程 网络工程1934 作业要求 结对项目 作业目标 结对编程,合作编写程序 合作者 3219000147 林于群 3219005360 朱丹彤 Github地址 Github地址 PSP2.1 Personal Software Process Stages 预估耗时(分钟) 实际耗时(分钟) Planning 计划 Estimate 估

P1014 [NOIP1999 普及组] Cantor 表

https://www.luogu.com.cn/problem/P1014 思路 首先理解题目主意:输入n,代表第几项,输出那一项的值 既然以Z字形编号,那我把每行按Z字形写开 第一行: 1/1 第二行: 1/2 2/1 第三行: 3/1 2/2 1/3 第四行: 1/4 2/3 3/2 4/1 根据列举,可以发现一些规律。 每行个数随着行数增加。 分子+

3D信息的分子图自监督表示学习 PRE-TRAINING MOLECULAR GRAPH REPRESENTATION WITH 3D GEOMETRY

原文地址:https://wyliu.com/papers/GraphMVP.pdf 摘要 分子图表示学习是现代药物和材料发现中的一个基本问题。分子图通常由其二维拓扑结构来建模,但最近发现三维几何信息在预测分子功能方面起着更为重要的作用。然而,现实场景中3D信息的缺乏严重阻碍了几何图形表示的学习。为

与多种疾病相关的PROTAC分子研究

蛋白降解靶向嵌合体(Proteolysis-Targeting Chimeras, PROTACs),是一种新的具有良好前景的药物类型,其结构类似于哑铃,通过一个连接子(linker)连接 “靶蛋白的配体”以及“E3泛素连接酶的招募配体”。换言之,PROTAC分子的一端与兴趣靶蛋白结合,另一端与E3泛素连接酶结合。而E3泛素连

PROTAC分子的重要应用丨疾病相关研究

根据霍华德休斯医学研究所 Dr. Brent Stockwell教授的一项调查,所有FDA(美国食品药品监督管理局)批准的组合药,仅与人体细胞中2%的蛋白相互结合。而许多重大疾病,比如癌症、自身免疫性疾病和神经变性疾病,都是由“不可成药”蛋白所引起,人体中多达85%的蛋白引起的疾病,无法用传统药物进

课题研究课例-08

武安市教育科学“十三五”规划课题 课题研究课例设计   姓 名 刘少哲 单 位 武安市第九中学 电 话 18733513660 课题题目 初中化学概念教学策略及案例的研究 课例题目 分子、原子(新授课) 年级及学科 九年级化学 研究设计   (结合课题研究内容,具

聊聊矩阵求导

引入概念:分子布局,分母布局 很简单,如果分子是列向量,就是分子布局 分母是列向量,就是分母布局。 知道了这些再去看B站视频 , (牢记,谁是列向量,就是 什么布局) 【手推机器学习】矩阵求导--合集_哔哩哔哩_bilibilihttps://www.bilibili.com/video/BV1xk4y1B7RQ?p=1

网友 lzmsunny96 的 一个 分数 分解题

网友  lzmsunny96  在 反相吧 发了一个 帖 《一个数学公式求证明》 https://tieba.baidu.com/p/7524528575  ,   提出了 一个 题 :       注意,   分母为不同正整数。      这题 就是 把 一个 分数 分解 为 多个 分子为一 且 分母不同 的 分数 之 和  。    如题, 

PyTorch笔记--Softmax函数求导

softmax是非线性激活函数的一种。它将神经元的输出变换到(0,1)的区间内。      需要注意的是对应的是分子中的指数项,而与分母是无关的。   下面对进行求导,     这里分为两种情况。 j==i          另一种情况是 j!=i    就是要注意对求导时,S的分子的指数项哪一项,刚