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【哈佛大学:计算生物学 & 生物信息学】学习记录(一)

第一部分 —— 关于计算生物学 & 生物信息学 & 本课程内容 (1)Protein Wave 【技术】Sanger测序了一个蛋白质序列 【算法】Needleman-Wunsch algorithm 【数据库】PDB(Protein Data Bank,蛋白质3D结构数据库) 【算法】BLAST —— instead of pairwise sequence alignment 【比赛】

全自动深度学习技术攻克了染色体生物学中的核心科学问题

  项目团队用了5年时间潜心研究,最终采用端到端的全自动深度学习技术和图像处理技术,与染色体生物学有机结合,攻克了染色体生物学中的核心科学问题,通过运用计算机信息科学的最新理论知识和方法,为解决染色体生物学领域中的挑战性难题,提供了新思路、新方法和新技术。项目形成的成果

细胞生物学名词解释

群文件,大量资料,自行下载 群内定期发送旗舰店好货,记得开启免打扰和置顶 正在跳转 名词解释题 细胞:是生命体活动的基本单位。 原位杂交:确定特殊的核苷酸序列在上染色体或细胞中的位置的方法称为原位杂交 脂质体:根据磷脂分子可在水相中形成稳定的脂双层的趋势而制备的人工膜。单层

从心理与生物学理智分析《死亡搁浅》的争议与其设计

IGN 6.8分 《死亡搁浅》自发售以来引发的争议和对立很大,且在向站队和无脑喷的方向发展,数个评测视频下面日渐乌烟瘴气,越来越少的人不再关注游戏本身,反而开上帝视角地图炮,实在不利于每个热爱游戏的玩家去好好权衡自己是否喜欢这个游戏。近期,《死亡搁浅》PC版发售,在此,谨从不同

Engine Biosciences宣布获得超额认购的4300万美元A轮融资,以通过机器学习和新一代组合遗传学破译新药开发遗传密码

推进药物发现和开发的先驱平台获得重要发现,助力多种癌症治疗 新加坡和美国加利福尼亚州圣卡洛斯--(美国商业资讯)--Engine Biosciences(“Engine”)专注于识别出复杂疾病遗传密码中的错误,并用精确的治疗方案对其进行修复,该公司今日宣布成功完成超额认购的4300万美元A轮融资。本轮

小鼠肿瘤生物学数据库

      简介小鼠肿瘤生物学(MTB)数据库(http://tumor.informatics.jax.org)是人类癌症小鼠模型的综合信息资源。该资源的目的是促进实验室小鼠的使用,作为调查人类癌症背后的遗传和基因组因素的模型系统。MTB数据库目前包含来自近7,000个不同群体的小鼠的超过46,000个小鼠模型(代表>

关于深度学习在生物学领域的应用分析

申明:本文来源于对论文“Applications of Deep Learning in Biomedicine”的理解。 深度学习研究及其在生物医药领域的潜在应用         深度学习已经在各种生物学应用中取得成功。在本节中,我们回顾了在各个研究领域进行深度学习的挑战和机会,并在可能的情况下回顾将深度学

什么是深度学习

深度学习是机器学习的一个分支领域:它是从数据中学习表示的一种新方法,强调从连续的层(layer)中进行学习; 在深度学习中,这些分层表示几乎总是通过叫作神经网络(neural network)的模型来学习得到的。神经网络的结构是逐层堆叠。神经网络这一术语来自于神经生物学,然而,虽然深度学习的一些核

生物学-知觉:知觉理解性

ylbtech-生物学-知觉:知觉理解性 知觉理解性即人们以已有的知识经验为基础去理解和解释事物,并用词语加标志的特性,以使它具有一定的意义。 1.返回顶部 1、 中文名:知觉理解性定    义:理解和解释事物影响因素:知识经验研究源自:生物学中的神经反射 目录 1 定义 2

计算生物学

计算生物学ex2 本实验使用Linux系统,华为云服务器,XShell连接 基因比对与文件操作 可视化使用Rstudio,IGV EXERCISE1 PART 1 在主目录下创建工作目录,用于存放此次作业所需要的文件 mkdir ex2 使用Xtpf7上传文档 上传之后展示如下 PART 2 fastqc使用 cd FastQC chmod 755 fastq

化学生物学进展_04

为什么关注的是Proteome和Phosphoproteome,仅仅关注一个基因和蛋白类似盲人摸象,所以更关注整个系统的研究而非单个的蛋白和基因 能够用质谱检测的probe chemical reporter(analogies糖、lipid 叠氮 炔基和wt分子长得很象,和wt在细胞中的behavior一样)–根据化学反应–缺点:质

GO富集分析示例

GO是Gene Ontology的简称,是基因功能国际标准分类体系。它旨在建立一个适用于各种物种的,对基因和蛋白质功能进行限定和描述的,并能随着研究不断深入而更新的语言词汇标准。GO分为分子功能(Molecular Function)、生物过程(Biological Process)、和细胞组成(Cellular Component)三个部

医学细胞生物学笔记1

毕业前跟去山东当老师的同学讨论时,他问什么是组学?虽然搞生物信息,但是具体也没有给他解释清楚。最近医学细胞生物学书里第一章我看到有相关的描述,于是总结一下。 现在的组学研究,个人理解狭义上就是指基因组学和蛋白质组学。这里所谓的组,就是指一套相对完整的遗传物质,包括基因和基因

高考失常错过清华,而今保送清华直博,还发了数篇 Nature

来源:北京化工大学封面来源:站酷海洛 Plus2013 年上半年,即将博士毕业的冯越正和现在忙着投递简历、参加春招的很多学生一样,面临着人生中的一个重大抉择:出国或国内做博士后?进企业?还是其他?面对各式各样的选择,权衡之下,冯越老师发现自己更喜欢在一个相对独立的环境中工作,他希望能够