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rsem对转录本进行定量

最近在研究转录本，现在在下载数据，想起来自己有一个博客，就暂且来这里更新一下内容。 要想对转录本进行定量，首先需要下载它的转录组数据，将别人上传的SRR文件的名字整理在wheat.txt中，引用 prefetch --option-file wheat.txt 下载后通过sratoolkits将sra数据转化成fq格式 fastq-dump -

java编程思想第四版第八章总结

1. 多态的含义 面向对象的三大基本特征: 封装,继承,多态。 多态是干什么的？ 多态将做什么和怎么做分离开。从另一个角度将接口是实现类分离开。 多态的作用 消除类型之间耦合的关系 使用多态的好处？ 能够改善代码的组织结构，提高代码可读性 能够创建可扩展的程序。 2. 方法的调用

SSR marker for wheat

1. first, open the wheat omics(excellent web),use the JBrowse of genome，locate your region,and select the left predicted_ssr database ,and then download the sqn format. 2. then,the left position of the ssr minus 250bp,and the right plus 250bp,and the form

使用树状图做层次聚类分析

一、实验目的 如果您以前从未使用过树状图，那么使用树状图是查看多维数据如何聚集在一起的好方法。 在这本笔记本中，我将简单探索通过层次分析，借助树状图将其可视化。 二、层次分析 层次分析是聚类分析的一种，scipy有这方面的封装包。 linkage函数从字面意思是链接，层次分析就是不断链

使用树状图做层次聚类分析

一、实验目的 如果您以前从未使用过树状图，那么使用树状图是查看多维数据如何聚集在一起的好方法。 在这本笔记本中，我将简单探索通过层次分析，借助树状图将其可视化。二、层次分析 层次分析是聚类分析的一种，scipy有这方面的封装包。 linkage函数从字面意思是链接，层次分析就是不断链