首页 > TAG信息列表 > vasp

LINUX下基于NVIDIA HPC SDK 的 VASP6.3.x编译安装报错整理

关于gcc 用旧版本安装NVIDIA HPC SDK再编译会报错: "/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/include/c++/8/bits/move.h", line 48: error: identifier "__builtin_addressof" is undefined 解决办法: 升级gcc 重新安装NVIDIA HPC SDK。先前安装的可以删除(rm -rf 文件夹)。安

VASP结构优化INCAR相关参数

IBRION =1,quasi-Newton法,对初始结构敏感,适合极值附近的优化 =2,conjugate gradient法,一般优先采取,待初步优化结束后,转换为1 =3,

VASP安装详解

VM16 + CentOS7 版 Linux 下安装 VASP6.1.2。 一、准备工作 主要是各种所需软件的安装和上传 VASP 相关的安装包。 1 VM16 的安装 虚拟机的安装,这里选用的是 VM16 版本,可以一并把 Linux 图形化界面安装上去。 双击一步一步往下安装,点击完成就行了,这里不再展示。 2 Linux 系统安装

(VASP报错)YOUR APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Killed (signal 9)

VASP提交后出现如下报错:   解决方法:   通过降低K点操作后可以正常计算 原因猜测:   较大的K点选取导致计算量激增,超过当前所用核数的计算能力承载范围,导致程序崩溃被终止   

intel oneapi编译VASP6.2版本遇到的难题及vasp_gpu的编译

由于是菜鸟,大牛莫见笑。采纳网上建议,在正确的编译器intel oneapi ,再加上配置正确的Linux操作系统ubontu2.04版本,vasp6.2+vtst编译,比较顺利。 以前病急乱投医,对make及makefile知道的不多,一顿乱操作,装了很多不同并行编译软件,因此在编译的过程,采用不是一个系统的不同编译并行

vasp编译问题遇到难题三:root与普通用户的权限

编译make 时,碰到打开某个路径文件不允许,这就碰到了执行权限问题。我是在root身份下编译。安装了Intel编译器,但是环境变量设置在/home/user/.bashrc. VASP有基于不同架构的makefile,而且对代码的编译也有不同的编译器。编译过程包括了预处理、编译、汇编、链接等功能。既然有不

VASP赝势简介

文章来源:“分子动力学”公众号 链接:https://mp.weixin.qq.com/s/TGU_0H2jktEwXIkqCdG3ug vasp计算中用到的三种赝势:模守恒赝势,超软赝势,PAW赝势(按产生顺序)。 按方法不同分为USPP(ultrasoft pesudopotential,超软赝势)和PAW(projector augmented wave,投影缀加平面波),两种方法都可

VASP服务器第一次安装各种软件(中)

安装xcrysden 官网下载 http://www.xcrysden.org/Download.html 用的是linux版本的source package 解压 tar zxf xcrysden-1.6.2.tar.gz 在Make.sys-semishared的基础上修改Make.sys文件,先cp system/Make.sys-semishared Make.sys 具体修改的不同比较地方如下: 安装make

VASP结构优化计算输入文件,程序执行和输出文件

VASP输入文件 1.INCAR文件 # 计算的体系的名称 SYSTEM = Hybrid # I/O设置(读入、读出) ISTART = 0 # 0代表一个全新的计算 ICHARG = 2 LWAVE = .FALSE. LCHARG = .FALSE. LVOT = .FALSE. LELF = .FALSE. #以上四个文件一般在需要计算准确电子结构(自洽运算)时才会出现 # Elec

VASP静态自洽计算的输入文件,执行和输出文件

VASP输入文件 1.INCAR文件 # 计算的体系的名称SYSTEM = Hybrid​# I/O设置(读入、读出)ISTART = 0 # 0代表一个全新的计算ICHARG = 2LWAVE = .FALSE.  LCHARG = .TRUE. #输出电子密度文件LVOT = .TRUE.   #loacl potential文件LELF = .TRUE. #输出电子局域化函数LORBIT = 11

使用intel编译器编译VASP

之前按照sob老师的教程安装了2019的intel编译器,然而发现编译出来运算速度非常慢,原因不明,之后按照youyno老师的教程《教你从头编译vasp-5.4.1》,安装了intel编译器2015,openmpi和fftw,使用openmpi中的mpif90而不是mpiifort作为FC,编译出来的vasp速度正常了。

基于CPU加速的VASP安装

VASP(Vienna Ab initio Simulation Package)由维也纳大学Hafner小组开发,进行电子结构计算和量子力学、分子动力学的模拟软件包。是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。本文是在intel parallel studio xe环境编译,intel parallel studio xe自带BLAS、FFTW、MPI等,p

PBS脚本示例

一: #PBS -N name #PBS -o out #PBS -e err #PBS -l nodes=2:ppn=4 #PBS -r y cd $PBS_O_WORKDIR mpirun -np 8 vasp_std > vasp-out  二: #PBS -N jobs_name #PBS -o out #PBS -e err #PBS -l select=host=cn198:ncpus=1:ngpus=1                     # cn198有个一

vasp计算之输入输出文件

一、vasp文件: INCAR in ** STOPCAR in stout out POTCAR in ** KPOINTS in ** IBZKPT out POSCAR in ** CONTCAR out EXHCAR in (should not be used in vasp.3.2 and vasp.4.x) CHGCAR in/out CHG