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qsub投递任务到指定节点(sge集群)

有2种方式: 1、投递到指定队列 qsub -q all.q  -cwd -V  cmd.sh 2、投递到指定节点 qsub -l hostname=node-01 -cwd -V cmd.sh   转载:https://my.oschina.net/leopardlinux/blog/807146

linux – 如何在qsub命令中使用管道或重定向?

我想在网格上使用需要使用管道(|)或重定向(>)的qsub(SGE 8.1.3,CentOS 5.9)运行一些命令.例如,假设我必须并行化命令 echo 'hello world' > hello.txt (显然是一个简化的例子:实际上我可能需要将像bowtie这样的程序的输出直接重定向到samtools).如果我做了: qsub echo 'hello worl

linux上的python中的os.system vs subprocess

我有两个python脚本.第一个脚本调用第二个脚本的表,我需要在其中执行第三方python脚本.它看起来像这样: # the call from the first script. cmd = "qsub -sync y -b -cwd -V -q long -t 1-10 -tc 5 -N 'script_two' ./script2.py" script2thread = pexpect.spawn(cmd) # end o

python – 使用qsub提交连续和独立作业的速度有多快?

这个问题与pbs job no output when busy有关.即我提交的一些工作在PBS / Torque“忙”时不产生输出.我想,当一个接一个地提交许多工作时,它更加繁忙,并且正如它所发生的那样,以这种方式提交的工作,我经常会得到一些不产生任何输出的工作. 这是一些代码. 假设我有一个名为“x_analys

linux – 使用qsub(sge)和多线程应用程序

我想向我正在使用的集群网络提交一个多线程作业 – 但关于qsub的手册页不清楚这是怎么做的 – 默认情况下我猜它只是将它作为普通作业发送而不管多线程 – 但这可能会导致问题,即将多个多线程作业发送到同一台计算机,放慢速度. 有谁知道如何做到这一点?谢谢. 批处理服务器系统是sge