首页 > TAG信息列表 > protein
The instruction of Protein
蛋白质 一般定义 蛋白质是由氨基酸以“脱水缩合”的方式组成的多肽链经过盘曲折叠形成的具有一定空间结构的物质。 一种蛋白质的序列由编码该蛋白质（或编码该蛋白质的一部分，对于多亚单位蛋白质）的基因的DNA决定。 胰岛素激素蛋白质结构： image credit: OpenStax Biology. 基因DNA序超全细胞器标记物抗体整理
细胞器（organelle）是细胞内具有特定形态结构和功能的微器官，也称为拟器官或亚结构，一般存在于真核细胞和原核细胞的细胞质中。在真核细胞中，细胞器通常由磷脂双层分开包裹。类似于身体的器官，细胞器是专门执行正常细胞操作的功能单位，其功能比较广泛，包括从为细胞产能到控制细胞生长和繁使用端到端深度学习模型完成PPI任务两篇论文笔记
1.“Multifaceted protein–protein interaction prediction based on Siamese residual RCNN” 1.1PPI任务的难点： （1）蛋白质的表征需要一个模型来有效地过滤和聚合它们的局部特征，同时保留重要的上下文和序列的氨基酸信息 (2)扩展深度神经结构经常导致低效的学习过程，并遭受臭名【R读取报错】错误: Can't bind data because some arguments have the same name
最近读取一个数据时，报如标题的错误。 args[1] <- "RT_10-VS-RT_0" all <- read.delim(paste0(args[1],".xls"),header = T,check.names = F) dat <- all %>% dplyr::select(Protein_ID,starts_with("Ratio"),starts_with("Qvalue"),starLoppinha, the boy who likes sopinha Gym - 101875E (搜索+dp)
Loppinha loves to go to the gym with his friends. He takes his training sessions very seriously, and he always follows his schedule very strictly. He just created a new plan where he has set exactly what he is going to do at every single one of the N minuPPI | protein-protein interaction | 蛋白互作分析 | gene interaction | 基因互作
前言 做RNA-seq基因表达数据分析挖掘，我们感兴趣的其实是“基因互作”，哪些基因影响了我们这个基因G，我们的基因G又会去影响哪些基因，从而得到基因调控的机制。 直觉确实是很明确的，但是细节处却有很多问题。 我们讨论的到底是基因表达的互作，还是基因产物的互作？ ------------ 对于蛋白编MGI数据库挖掘 | MGI-Mouse Genome Informatics | InWeb database
做生物信息，遗传发育，分析数据的时候总是要narrow down分析范围，高通量数据尤其是基因表达，在庞大的confounder面前，缩小分析范围是必须的，否则你会一直在混沌中游荡。 看一篇文章：2018 - Identification of genes associated with Hirschsprung disease, based on whole-genome sequenPDB(Protein Data Bank)数据格式详解
PDB(Protein Data Bank)是一种标准文件格式, 其中包含原子的坐标等信息, 提交给 Protein Data Bank at the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) 的结构都使用这种标准格式. 这里整理网上已有的一些资料, 对PDB格式做个简短介绍. 对大多数用户而言, 了解