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windows下直接跑MEME suite?对!任何人都可以。

Motif,模式,pattern,如下。我个人理解为:一组具有类似特征的序列。而在分子序列中,那么就是具有类似分子(如碱基或氨基酸)的序列。 Motif,不是一个序列,所以在生物序列分析时,无论是预测和挖掘,都并不是简单的完全匹配就能完成,他的处理,有点像正则表达式,但事实上,应是HMM。这种情况下,使

meme CentriMo富集 motif匹配序列的获取

背景 当我们使用 CentriMo 进行motif 富集后,如采用下面的命令 $ centrimo -oc test test.500l.fa $meme_motif 会在test目录产生三个文件(centrimo.html,centrimo.tsv,site_counts.txt),用浏览器打开centrimo.html后,点击motif id前面的复选框后,会在左边位置的文本框显现出motif匹配的

IOCMIN: Identification of Conserved Motifs in Networks

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