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【实验记录】9月9日-9月11日
今天的计划就是说，我要把这块自己给自己弄出来点东西来。 希望在汇报前能够完成的事情： (1) 我要弄明白为什么在基因和表观组层面存在那么多的不一样。 (2) 希望把gwas的结果弄出来。 (3) 找到一些候选的感兴趣的片段，并被各方面的数据认真地证实。 你要认真，你要靠自己，你要专注，你要自【实验记录】7月30日 复现作者的示例代码-Roadmap
ssh xxzhang@192.168.79.84 cd /home/xxzhang/data/Epigenome/Roadmap/ 1、拆分原始bed文件，并重命名文件名 (base) [xxzhang@cu08 Roadmap]$ python /home/xxzhang/workplace/software/giggle/examples/rme/rename.py /home/xxzhang/workplace/software/giggle/examples/rme/sta【实验记录】2022年7月20日-7月22日
今日目标：（1）阅读文献：GIGGLE；（2）将其应用到cistromDB转录因子的那套数据中； 一、文献整理 1、GIGGLE用以解决什么问题？ 结合已有的表观组的数据，如open chromatin,enhancers和transcribed regions,对我们感兴趣的基因组位点进行注释。 2、GIGGLE的优势： （1）检索的速度快；（2）对结果进行排名，找到最