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seurat 单细胞数据分析中 VizDimLoadings 函数
前期处理:https://www.jianshu.com/p/fef17a1babc2 #可视化对每个主成分影响比较大的基因集 001、 dat <- pbmc[["pca"]]@feature.loadings ## 数据来源 dat[1:3, 1:3] dat <- dat[order(-dat[,1]),][1:29,1] dat <- as.data.frame(dat) daseurat 单细胞数据分析中 DimPlot函数实现pca
前期处理参考:https://www.jianshu.com/p/fef17a1babc2 001、 dat <- pbmc[["pca"]]@cell.embeddings ## 绘图数据 dat[1:3, 1:3] plot(dat[,1], dat[,2]) ## 绘图 标准结果: