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[GSEAPY] 在Python里进行基因集富集分析
前言 在生物信息学数据分析中，许多分析软件都是基于R开发的。这里介绍一个可以在Python 中进行基因富集分析的Python 软件 GSEAPY (Gene Set Enrichment Analysis in Python) GSEApy is a python wrapper for GESA and Enrichr. It’s used for convenient GO enrichments and在线的基因集富集分析工具——Enrichr
简介Enrichr是一个基于网页端的综合性的基因集富集分析工具。富集分析是用于分析由全基因组实验产生的基因集合的流行方法。在这里，我们介绍一个重要的更新到这个域名为Enrichr的工具（此为第二版）。 Enrichr目前包含大量可用于分析和下载的基因组库。 EnclusterProfiler::enrichGO() is getting very slow
REF https://www.biostars.org/p/389208/ https://github.com/YuLab-SMU/clusterProfiler/issues/155 https://cran.r-project.org/web/packages/enrichR/vignettes/enrichR.htmlhttps://bioconductor.riken.jp/packages/3.2/bioc/vignettes/clusterProfiler/inst/doc/clust