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如何查找序列fastq文件和找到参考基因组

首先是一个SIRV的数据,论文中给出了AC:SRR5286959,在ebi中可以搜到相关链接,并下载fastq文件。 在ebi的页面下方,Study Accession的意思是研究相关的内容,打开页面可以看到来源于哪个物种。 然后可以在另一个网站(https://asia.ensembl.org/index.html)找到这个物种(Mouse)的参考基因组

EBI数据库下载数据

EBI网址链接: https://www.ebi.ac.uk 方法:直接从ncbi上面找到想要下载数据的SRR号然后去EBI里面直接搜索即可得到。   底部就是想要下载的fastq文件了:    然后右键复制链接地址,直接到服务器上面wget -c 加链接地址就可以完成数据的下载。