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galaxy circos之Microbe Tutorial
今天呢，主要记录的是如何用galaxy生物信息分析平台上的circos工具做可视化。参考文献如下： [1] https://academic.oup.com/gigascience/article/9/6/giaa065/5856406 首先我们要进入galaxy的线上平台 https://usegalaxy.eu/ ，进行账号注册。完成后，在“数据共享”下“我的历史”模块你还不会安装Circos？其实就三步！！！
前言前面我们介绍了Circos的使用，还没来得及看的可以移步查看“Circos:我其实真的没那么难画!”这篇文章刊出后，受到了广泛的讨论，认为其基于perl编写、难以使用的不下少数，也有牛人基于python做了简单的实现，不过编者看来可以归结为“会者不难，难者不会”。曾记生物制图软件——CirCos在Linux服务器上安装步骤：
在linux下安装：1.官网下载压缩包2.目录下解压：$ tar xvf circos-0.68.tar3.生成软连接 ln -s circos-0.68 currentls4.写入当前用户的环境变量中vi ~/.bash_profile5.写入环境变量export CIRCOS_HOME=${HOME}/softWare/currentexport PATH=${PATH}:${CIRCOS_HOME}/bin6.激活环境变量学习笔记167—circos 可视化手册- fonts 篇
在circos中，fonts, colors, patterns这3个系统内置的block, 通过同一个配置文件引入，写法如下 <<include etc/colors_fonts_patterns.conf>> 这个文件的内容如下： 通过include, 将color, fonts, patterns对应的3个配置文件分别引入。 本章看下fonts相关的内容，etc/fonts.conf的部学习笔记165—Circos入门总结【for Brain Network】
Circos (http://circos.ca/) is a very useful tool for generating circular figures. Initially, it is designed for genome network studies, but we also could apply it in neuroscience or other fields. According to my knowledge, not so many Chinese summary foCircos图
Circos官网 http://circos.ca 在线绘图工具 http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/ Circos图的诞生 Circos图诞生于2009年，当时是作为一个绘图工具类的文章发表在Genome Research（最新IF：9.944）上，其作者是Martin Krzywinski，可为“Circos之父”，我们姑且尊称他为“马