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Scanpy源码浅析之pp.normalize_total
版本 导入Scanpy, 其版本为'1.9.1',如果你看到的源码和下文有差异,其可能是由于版本差异。 import scanpy as sc sc.__version__ #'1.9.1' 例子 函数pp.normalize_total用于Normalize counts per cell, 其源代码在scanpy/preprocessing/_normalization.py 我们通过一个简单例子来Scanpy源码浅析之tl.score_genes_cell_cycle
版本 导入Scanpy, 其版本为'1.9.1'。 import scanpy as sc sc.__version__ #'1.9.1' 功能 函数tl.score_genes_cell_cycle用给定S phase 和 G2M phase的两个基因集,计算打分,然后根据得分分配细胞phase, 其源代码在scanpy/tools/_score_genes.py 关于打分细节,见上一篇https://www.