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在VMD上可视化hdf5格式的分子轨迹文件

技术背景 在处理分子动力学模拟的数据时,不可避免的会遇到众多的大轨迹文件。因此以什么样的格式来存储这些庞大的轨迹数据,也是一个在分子动力学模拟软件设计初期就应该妥善考虑的问题。现有的比较常见的方式,大致可以分为存成明文的和存成二进制的两种方式。这两种方式各有优劣,明文

安装VMD 可视分子动力学

VMD是一种功能丰富的分子可视化程序包,可使用3D显示图形,设置动画和分析大型生物分子系统。 备注:Linux下需要安装桌面<CentOS7.x安装桌面>;   1、下载VMD软件# wget https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/vmd-1.9.4/files/alpha/vmd-1.9.4a55.bin.LINUXAMD64-CUDA102-OptiX650-OSPR

鲸鱼优化算法(WOA)优化变分模态分解(VMD)包络熵的特征提取及MATLAB代码实现

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变分模态分解(VMD)运算步骤及源码解读

1. 简述 VMD的目标是将实值输入信号 f f f分解为离散数量的子信号(模态) u k

BOOST_VMD_ASSERT_IS_ARRAY宏相关的测试程序

  BOOST_VMD_ASSERT_IS_ARRAY宏相关的测试程序     实现功能 BOOST_VMD_ASSERT_IS_ARRAY宏相关的测试程序 C++实现代码 #include <boost/vmd/assert_is_array.hpp> #include <boost/detail/lightweight_test.hpp> int main() { #if BOOST_PP_VARIADICS