Tumor

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第一题

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论文学习 Dilated Inception U-Net (DIU-Net) for Brain Tumor Segmentation 1

好记性不如烂笔头边学习边记录1 主题：脑肿瘤分割使用基于Unet的端到端的网络结构，在扩张和紧缩路径中加入了Inception模块和空洞卷积。数据集：Tumor Segmentation (BraTS) 2018 dataset 结论：该方法对神经胶质瘤三个子区中的两个(肿瘤中心和整个肿瘤的分割)的分割效果有所提升。

一个实验设计项目

随机生成小鼠肿瘤生长数据想要模拟真实世界的情况本身就非常困难。受限于本人数学水平，勉强生成一批均值和方差不断增大的数据，来模拟小鼠肿瘤生长的情况。在这过程中，参考了一些肿瘤方面的文章。 TEM8 marks neovasculogenic tumor-initiating cells in triple-negative breas

实验记录 | mutect问题详解:No tribble type was provided on the command line and the type of the file？

出错详情： /home/xxzhang/workplace/software/java/jdk1.7.0_80/bin/java -Djava.io.tmpdir=./output_RNA/mutmp -Xmx31g -jar /home/xxzhang/workplace/QBRC//somatic_script/mutect-1.1.7.jar --analysis_type MuTect --reference_sequence ./geneome/hg19/hg19.fa --dbsnp