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HiC-Pro mergeSAM.py报错

报错信息 Forward and reverse reads not paired. Check that BAM files have the same read names and are sorted. 分析 提示是没有排序或者R1、R2没有配对,手动sort再分步运行HiC-Pro samtools sort -@ 10 -n -m 10G -T temp1 xxxR1.bam > xxxR1.sort.bam samtools sort -@ 10

软件:S/HIC 利用随机森林识别 软/硬 清扫

内容翻译整理自文章 S/HIC: Robust Identification of Soft and Hard Sweeps Using Machine Learning,PLoS Genet.,2016 March 15,被引用次数 118。 S/HIC 软件特色 相比已有软件,S/HIC 软/硬 清扫图谱的识别精度 得到了提高。S/HIC 软/硬 清扫图谱中受选择位点的识别更为精准,相

Q345R(R-HIC)-Q345R(R-HIC)焊接选择

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hic的ice命令的问题

hic的ice命令的问题 把ice的代码更新为下面的代码就可以了 #!/home/s312/miniconda3/envs/rna/bin/python import sys import argparse import numpy as np from scipy import sparse import iced from iced.io import loadtxt, savetxt parser = argparse.ArgumentParser(“