Chr1

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linux shell实现 GWAS显著性区域的合并

001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# ls record.sh region.bed root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# wc -l region.bed ## 测试数据 1058 region.bed root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# head -n 5 region.bed ## 测试数据 Chr1 1560051 1570051 3.6112E-10 Ch

gwas分析中根据显著性p值筛选上下游10k位点

001、awk 实现 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# ls pvalue.bed root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# cat pvalue.bed ## 第一列染色体，二列pos，三列p Chr1 1570052 3.6112E-10 Chr1 5188622 5.6283E-8 Chr1 5188673 4.6785E-8 Chr5 3646289 6.8643E-