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Bioconductor镜像的使用方法
安装环境:R-3.5.3 source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”) #指定一个离你最近的国内镜像 options(BioC_mirror=“http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/”) biocLite(“Bioconductor”) 选择一个生信包进行安装edgeR:一个数字基因表达数据差异表达分析Bioconductor程序包
edgeR:一个数字基因表达数据差异表达分析Bioconductor程序包 人们希望在不久的将来,对于许多功能基因组学应用,新兴的数字基因表达(digital gene expression,DGE)技术将超过微阵列技术。基本数据分析任务之一,特别是对于基因表达研究,涉及到确定是否有证据表明一个转录本或外显子的计数关于BiocManager更新
这几天发现我的BiocManager使用不了了: Bioconductor version '3.8' is out-of-date; the current release version '3.9' is available with R version '3.6' 一直提示这个问题,后来我在github的项目 issue里找到了解决方式 BiocManager::install(version="3.9")当R安装包package ‘XXX is not available (for R version 3.5.1)
遇到这个情况,说明包源不在或者改了地方,那就换个办法呗 比如corrplot就这样子安装: source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("corrplot") library("corrplot") 哦,还可以自己去官网下载本地安装,具体咋做以后再说补充哈linux – 降级R版和R包Bioconductor
参见英文答案 > How to install 2 different R versions on Debian? 4个 大家好,我目前在带有Bioconductor v2.13的debian服务器上运行R 3.0.2.我的问题很简单,虽然通过互联网搜索没有给我一个明确的答案: