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【基因组预测】braker2基因结构注释要点记录
目录流程使用问题 记录下braker2的使用要点,以备忘记。 流程使用 braker2有很多流程,根据你的数据:组装的基因组、转录组、蛋白(同源,包括近缘或远缘)选择不同流程,官网有说明: https://github.com/Gaius-Augustus/BRAKER 现在的动植物组装,大多数都含有以上三类数据吧,因此可选择如下流程,用《关于GAN的七个问题:谷歌大脑工程师带你梳理生成对抗网络的过去未来》
关于GAN的七个问题:谷歌大脑工程师带你梳理生成对抗网络的过去未来 量子位 鱼羊 发自 纽凹非寺量子位 报道 | 公众号 QbitAI 比起自己埋头写论文,聊聊自己感兴趣的方向,期待一下旁人的智慧,或许也是个不错的主意。 谷歌大脑研究员Augustus Odena最近有了新的Augustus 进行基因注释
目前的从头预测软件大多是基于HMM(隐马尔科夫链)和贝叶斯理论,通过已有物种的注释信息对软件进行训练,从训练结果中去推断一段基因序列中可能的结构,在这方面做的最好的工具是AUGUSTUS它可以仅使用序列信息进行预测,也可以整合EST, cDNA, RNA-seq数据作为先验模型进行预测。 安装