1N42TVH

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linux 中awk命令计算同一列相邻上数值的差

001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# cat a.txt 1570051 1570053 5188621 5178672 5188703 5178724 5188900 5178925 5188932 5179705 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# awk 'BEGIN

linux 中 sort命令 -k选项

sort -k选项用于指定按照哪一列进行排序。 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# ls facebook.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test# cat facebook.txt google 110 5000 baidu 100 5000 guge 50 3000 sohu 100 4500 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test

linux 中shell统计fasta文件中每条染色体上的碱基数目

001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# ls test.fa root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5/test/test# cat test.fa >Chr1 ACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAACCCTAAAC ACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAAACCCTAACCCTAAAC >Chr2 ACCCTAAACCCTAAAC

linux 中删除匹配特定字符的行及其后的若干行

001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 1 01 2 02 3 AAA 4 03 5 04 6 03 7 BBB 8 06 9 07 10 BBB 11 08 12 CCC 13 09 14 AAA 15 10 16 BBB 17 33 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# sed '/AAA/d' a.tx

linux 中 sed命令匹配特定字符之间的数据

001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 01 02 AAA 03 04 05 BBB 06 07 08 CCC 09 10 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# sed -n '/AAA/,/BBB/p' a.txt ## 匹配AAA和BBB之间的数据 AAA 03 04 05 BBB 002、

linux 中 sed命令匹配特定字符之间的数据

plink 软件中 --reference-allele 参数用于设定参考等位基因

001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# ls ## 测试数据 outcome.map outcome.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test4# cat outcome.map 1 SNP1 0 55910 1 SNP2 0 85204 1 SNP3 0 122948 1 SNP4 0

linux 中实现数据的每一列都对齐

001、column -t实现 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# ls xxx.genome root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# cat xxx.genome ## 测试数据 FID1 IID1 FID2 IID2 RT EZ Z0 Z1 Z2 PI_HAT PHE DST PPC RATIO 5 5 7 7 UN NA 0.433

linux 中awk命令实现字符串的精确匹配

001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat test.txt ## 测试数据 AKCR02000001 df AKCR02000001 df AKCR02000001 er AKCR02000001.1 dg AKCR02000001.1 der AKCR02000001.1 fg AKCR02000001.2 ee AKCR0200

linux 中%.*、%%.*的意义

1、举例%.*的作用 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# a="aa.bb.cc.dd" root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# echo ${a} aa.bb.cc.dd root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# echo ${a%.*} ## %.*的作用是删除变量最后一个.及其后的内容 aa.bb.cc root@DESKTOP-1N42TVH:/ho

R语言中利用optparse包给函数传递参数

1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt test.r root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat test.r #!/usr/bin/Rscript library(optparse) option_list <- list( make_option(c("-a", "--aa"), type = "character"), make_op

ubuntu中查看防火墙状态、关闭、开启防火墙

1、查看状态 root@DESKTOP-1N42TVH:/home# ufw status ## 开启状态 Status: active 2、关闭防火墙 root@DESKTOP-1N42TVH:/home# ufw disable Firewall stopped and disabled on system startup root@DESKTOP-1N42TVH:/home# ufw status Status: inactive 3、

sshd: no hostkeys available -- exiting.

1、问题，在启动ssh服务是出现如下问题 2、解决方法 root@DESKTOP-1N42TVH:/home# ssh-keygen -A ssh-keygen: generating new host keys: RSA DSA ECDSA ED25519 3、测试 root@DESKTOP-1N42TVH:/home# service ssh start * Starting OpenBSD Secure Shell server

QStandardPaths: XDG_RUNTIME_DIR not set, defaulting to '/tmp/runtime-root'

1、问题 2、解决方法 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# vim /etc/profile ## 在配置文件末尾追加如下两句 export XDG_RUNTIME_DIR=/usr/lib/ export RUNLEVEL=3 source一下： root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# source /etc/profile 3、测试（刚才的问

linux 中调用shell脚本时指定工作目录为shell脚本所在的目录

1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls /home/test2/* /home/test2/a.txt /home/test2/test.sh root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat /home/test2/test.sh ## shell脚本所在目录及内容 #!/bin/bash wc -l ./a.txt root@DESKTOP

linux 中 grep -q选项

1、linux 中 grep -q选项表示静默输出，即不显式匹配结果 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt ## 测试数据 d e j s q u z c b root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# grep "s" a.txt ## 直接输出匹配结果

ubuntu: Network error: Connection refused

1、问题： Network error: Connection refused 2、解决方法 root@DESKTOP-1N42TVH:~# /etc/init.d/ssh status * sshd is not running 3、 root@DESKTOP-1N42TVH:~# /etc/init.d/ssh restart * Restarting OpenBSD Secure Shell server sshd

linux 中实现每两列数据合并为一列数据

1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt e t d u e i a d g g z j c b d e w l z c b h j h 2、形式1 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt e t d u e i a d g g z j c b d e w l z c b h j h ro

linux 中awk命令计算每行数据的和、平均数、最大值、最小值

1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 3 1 4 2 1 2 6 3 2 1 3 3 2、计算每行数据的和 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 3 1 4 2 1 2 6 3 2 1 3 3 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# awk '

多组一列数据的处理

1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt chr168 0.5 0.66 0.77 0.3 chr254 0.6 0.3 0.89 chr678 0.658 0.5 chr344 0.53 0.596 0.65 0.68 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# awk -v RS='chr' 'NR!=1{

linux 中 awk NF的作用

1、删除空行 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt df gfdg df gg er fd gg ww kkkk jjjj root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat -A a.txt df gfdg$ $ df gg er$ ^I^I$ fd gg ww$ ^I^I$ kkkk jjjj$ root@DESKTOP-

linux中sed命令匹配特定字符之间的数据

1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt ## 测试数据 01 02 AAA 03 04 05 BBB 06 07 08 CCC 09 10 2、匹配AAA到BBB之间的数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt 01 02 AAA 03 04 05 BBB 06

linux中gzip解压文件并保留原始压缩文件

1、直接解压，不保留原始文件 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls outcome.map.gz root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# gzip -d outcome.map.gz root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls outcome.map 2、解压并保留原始压缩文件 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls outcom

linux 中sort命令 -k选项

1、-k 指定域 + 位置 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 google 110 5000 baidu 100 5000 guge 50 3000 sohu 100 4500 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# sort -k 1 a.txt ## 按照第一列排序 baidu 100 50

linux中实现将连续的多列数据合并为一列数据

1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt 01 02 03 04 05 06 07 08 09 11 12 13 14 15 16 17 18 19 2、实现将连续的三列数据合并为一列数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/