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GEO代码分析流程 - 3. 数据质控 - PCA、热图

3. 数据质控 - PCA、热图 rm(list = ls()) load(file = "step1output.Rdata") load(file = "step2output.Rdata") #输入数据:exp(表达矩阵)和group_list(分组信息) #Principal Component Analysis(PCA图,主成分分析图) #PCA代码来源:http://www.sthda.com/english/articles/31-princ

dplyr包

dplyr包 数据质控神器,接触R语言也4年了,一直没时间去学习这个包,最近有机会使用,有空就记录一些使用方法。 Install 安装dplyr install.packages("dplyr") Usage 分类汇总 数据格式: ups.melt <- na.omit(dd) %>% group_by(A,B) %>% summarise(num = n()) 经转换后数据格

2021-05-12

宏基因组分析流程--Step1检查原始数据质量 详细内容见 微信公众号 【阿呆ForFun】 https://mp.weixin.qq.com/s/SrmgNw-R5Zh2x_iHtWo6PQ 涉及到的内容太多,所以阿呆这里每天整理一点,成一个小系列。后期有改进的地方会及时更新~   Step1: Fastqc 检查原始数据质量 Step2: Trimmom

B站公告乌龙,文档质控机器人帮忙来纠错

    3月26日,哔哩哔哩(简称“B站”)在港交所披露的最新公司资料表中出现了失误,将企业名字“哔哩哔哩”错写成了“百度集团”,引起了各界人士的广泛关注和讨论。   其实这类上市公告中的人为错误导致的乌龙事件,在金融领域的文书中一点都不罕见。比如:苏美达曾经发布的关于“发行超

LIS是什么?【质量控制】

继续【LIS是什么?】中提到的【质量控制】。 Ⅱ.质量控制要求非常专业,现在只说一说个人理解,以下仅为LIS检验中部分理解,实际上实验室质量控制还包含的报告时效,实验室温度、湿度等等一系列内容,是一个庞大的体系模块。 无论是参与实验室系统招标,实验室LIS系统实施,还是实验室评级/复审,客

Echarts实现折线图

1.引用Echarts的js var arr =[]; var rgs=[]; var jqs=[]; 这里调用ajax把对应的值赋给定义的数组 function chartShow(arr,rgs,jqs) { myChart.setOption({ title: { text: ‘质控月度评分’ // 标题栏 }, tooltip: { // 提示框 trigger: ‘axis’, // 触发类型 axisPoint