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[转] 可变剪接及其表观遗传调控
开始接触这方面的东西,难啃的骨头,记录之: 可变剪接及其表观遗传调控(万字长文总结) 公众号:Epigenetics表观遗传学,有不少这方面的科普。土木工程材料的基本性质
密度:质量与体积之比 表观密度:材料在自然状态下,质量与体积之比。 \[\rho_0=\frac{m^‘}{V_0} \]\(V_0\)为表观体积 堆积密度:材料在堆积状态下,质量与体积之比。 \[\rho_0^‘=\frac{m^‘}{V_0^‘} \]\(V_0^‘\)为堆积体积 \[密度>表观密度>堆积密度 \]空隙率: \[P=\frac{V_p}{V_0}=\fr易基因 - 精准医学:DNA甲基化揭示了急性髓系白血病潜在的发育和致病途径|治疗研究
易点评 急性髓系白血病(AML)是一种复杂的分子疾病,具有异质性的肿瘤遗传学特征,涉及多种致病机制。在本研究中,作者对649例AML患者进行了全基因组DNA甲基化测序。整合的遗传分析数据显示,大多数类型与某种反复发生的突变有关。对DNA甲基化模式进一步分析发现,各个类型之间存在着独建立表观遗传修饰和转录因子结合位点的关系模型
摘要在基因表达调控中,TFs和表观遗传修饰起到关键作用,已经发现了两者间的相关性。然而,定量研究相关性的方法有限。本文提出了一种计算机方法,系统研究染色质体系结构或DNA序列中的表观遗传改变如何与TF结合相关,采用统计学分析去阐明表观遗传修饰可以预测T【培训】DNA甲基化与表观基因组学数据挖掘与分析技术
各企事业单位:表观遗传学是后基因组时代生命科学研究的前沿。有越来越多的证据表明,由核小体、DNA甲基化、组蛋白修饰构成的表观基因组对癌症、阿尔茨海默症、孤独症和心脏病起到了一定的作用。随着实验技术的进步,产生了海量的表观基因组数据,从这些数据中挖掘生物学特征对理解生命的单细胞表观基因组学:记录过去和预测未来
摘要单细胞多组学最近成为一种功能强大的技术,可以同时记录不同层次的基因组输出,从而记录细胞的身份和功能。将表观基因组的各个组成部分整合到多组学测量中,可以在不同的时间尺度研究细胞异质性,并发现基因组与其功能输出之间的分子连通性的新层次。越来越多的测量数据来自于那些识别Sequential regulatory activity prediction across chromosomes with convolutional neural networks
Sequential regulatory activity prediction across chromosomes with convolutional neural networks 基于卷积神经网络的染色体序列调控活动预测 摘要 基因预测表型 从DNA序列预测大型哺乳动物基因组中细胞类型特异性的表观遗传和转录谱。 利用CNN对启动子和远端调控元件进行非模式种表观遗传变异生态学文献
Herrera, C.M., Bazaga, P., Pérez, R. and Alonso, C. (2021), Lifetime genealogical divergence within plants leads to epigenetic mosaicism in the shrub Lavandula latifolia (Lamiaceae). New Phytol. Accepted Author Manuscript. https://doi.org/10.1111/nph.1725常见基因组功能数据介绍 | 表观注释 | DNase-seq | H3K27ac | H3K4me1 | eQTL | ENCODE | ROADMAP
functional genomics | epigenomic annotations 刚入行的总是一头雾水,对这些表观的标记一点兴趣都没有,种类繁多,总是记不住,这里我就做一个常识性的总结,不搞太多术语。 需要了解的也不多,常见的就那么几个,搞懂ENCODE和ROADMAP上有的就行。细节颇多,需要一点耐心。 各种类型的数据可以组学前沿:表观遗传调控的抗肿瘤免疫|综述案例
背景 表观基因组的调控异常驱动了转录程序的异常,从而促进了癌症的发生和发展。基因调控缺陷除了经常影响致癌和肿瘤抑制网络之外,参与抗肿瘤反应的肿瘤免疫原性和免疫细胞也可能受到表观基因组改变的影响。这一发现对表观遗传疗法和癌症免疫疗法及其组合疗法的开发和应用具有