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叶绿体基因组分析须要注意的地方（注释篇）
叶绿体基因组分析须要注意的地方（注释篇） 上期我们讲了组装问题，在组装完成后，就需要对序列进行注释了，叶绿体基因组的注释通常是经过同源比对注释的，同源注释的软件比较多，针对叶绿体基因组注释的软件也有很多，但是目前还没有一款可以得到完美注释结果的软件，所以学会自己检查注叶绿体基因组分析须要注意的地方（组装篇）
叶绿体基因组组装须要注意的地方 随着测序技术以及生信技术的发展，越来越多的叶绿体基因组被发表。本人从19年那8月份开始正式接触叶绿体基因组的组装，到今年2月份组装了接近600个叶绿体基因组，包括71+个科，157+属/种（其他的还做了动物线粒体100多个，植物线粒体30多个）。从叶绿体基因组圈图
1.CPGAVAS http://47.96.249.172:16019/analyzer/annotate 打不开了 2.OGdraw：http://ogdraw.mpimp-golm.mpg.de/index.shtml（一般文章常用圈图网站，但最近已崩） 3.GenomeVx：http://wolfe.ucd.ie/GenomeVx/(输入.gb格式） ![SWLD63_~]24_OP0T812CYWR.png](https://imgconvert.csdnictDNA|intron参与共生事件
5.10叶绿体基因组编码多种蛋白质和RNA 叶绿体和线粒体的共同点：叶绿体和线粒体的大小，功能（编码区）大体一致，但叶绿体拥有更多基因，所以在编码tRNA时，也有内含子作为被剪切片段。 因为在原核生物仅拥有非断裂基因的时候，本来存在一个完整内含子，但是由于制造蛋白质事件（共生事件），一部分