用Sybyl对3个天然产物库处理

用Sybyl对3个天然产物库处理

•包括简单的去重复分子和3D构象生成（没有对Bad group进行去除）

•1、 Chemdiv 得到8124个分子，重复分子2510个分子 
•2、 Zinc得到96991个分子，重复分子70513个分子 
•3、 J&K得到84712个分子，重复分子8788个分子 

•将3个库合并得到189827个分子，去重后得到144564个分子
由于表单过大，导致SYBYL对接过程中断及无法打开等情况，采取将数据库拆分及其他的方法重新进行操作；

用Sybyl进行二次处理144564个化合物，根据1 、 2 、3 三个不同方法

    1、Fliter by undersirable substructures
    2、Fliter by Standard Lipinski Rules
    3、Fliter using PAINS 

总结：
1、 Fliter by undersirable substructures
2、 Fliter by Standard Lipinski Rules
3、 Fliter using PAINS
1、 144564 = 67873 + 76691
2、 144564 = 100097 + 44467
3、 144564 = 129674 + 14890
12、 144564 = 45322 + 99242
23、 144564 = 91554 + 53010
123、144564 = 80181 + 64383
其中1包含3

Fliter by undersirable Substructures 包含右图的表单， 共38类结构

标签：分子,undersirable,重复,144564,天然,Fliter,Sybyl,产物
来源： https://blog.csdn.net/boqiang531/article/details/111855626