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群体遗传,进化分析利器Popgene分享给大家

作者:互联网

Popgene分析方法:
SSR为显性分子标记,故将实验分析数据作为单倍型数据进行统计,在某一位点上依据条带的有或无分别记为1或0,输入Excel表中形成二元数据矩阵。在此数据基础上进行如下统计分析:多样性分析,运用POPGENE Version 1.31软件计算地椒各种群间及种群内全部个体多态位点百分率、种群总基因多样性(Ht)、种群内基因多样性(Hs)、种群间的遗传分化指数(Gst)(Gst= 1 - Hs/Ht)、Nei’s 基因多样性指数(H)、Nei’s 遗传距离和遗传一致度及Shannon多样性信息指数(I),并对种群间及种群内个体进行聚类分析。可配合采用Arlequin Version 3.01软件包进行AMOVA分析,统计种群内和种群间的方差、方差分量及贡献率,依此量化评价基因多样性在种群间和种群内的差异和贡献,并做差异显著性检验。

附上国内可用下载地址:
下载地址:https://download.cnet.com/Popgene/3000-2054_4-75328340.html
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标签:种群,进化,Popgene,遗传,基因,多样性,Nei,利器
来源: https://blog.csdn.net/qq_36608036/article/details/104662697