ITK-SNAP打开Synapse数据集

1、参考：02-ITKSNAP基本使用-知识-名师课堂-爱奇艺

test后得到预测结果：测试集每个样本对应三个nifti格式（3D）的图像文件，原图像、分割真实值ground truth和预测的分割结果

使用ITK-SNAP软件打开原图像文件，可通过file->main image，选择进来；也可直接拖拽进来，并选择main image。

选择img图像后，再将gt图像（里面有label值，对应不同颜色）添加进来作为分割图像。另外再打开一个软件窗口，将img图像选择作为additional main image，再将pred图像（里面有label值，对应不同颜色）添加进来作为additional segmentation image。

两个窗口自动同步进行，对比看即可。

 下图是打开图像有一个失真提示。

 

 

 

 其中，zoon to fit，都点击后恢复原本样子；点击小窗口右上方框A能全屏，点击照相机标志可以截屏此处的帧；滚动滚轮，帧数切换；右键拖拽放大或缩小图像；右下角显示70 of 139指有139维，现在是第70张，点击左边那个图层图标的info可查看维度信息；点击左边的调色盘图标可查看label值及相应颜色RGB信息，此处自己可以按照需要更改，可通过FastStone Capture等软件的取色器取色并设置。

 

2、取几帧gt和pred对比图放到visio里面组合，做成数据集图。

标签：Synapse,ITK,image,取色,label,点击,图像,SNAP,main
来源： https://blog.csdn.net/ray7777777777/article/details/120560133