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单细胞开放染色质数据分析 | scATAC-seq
终于要开始分析scATAC-seq数据了，联合scRNA-seq就可以做multi-omics，可以深入挖掘TF的调控机制。 基本教程： scATAC-seq建库原理，质控方法和新R包Signac的使用 分析工具： signac - https://github.com/timoast/signac QC PCA and UMAP peak to gene integration witCF1056E Check Transcription 题解
Link. Codeforces Luogu Description. 给定一个 \(01\) 串 \(s\)，保证至少有一个 \(0\) 和 \(1\)，有一个目标串 \(t\)。 问有多少种字符串 \(r_0,r_1\)，使得把 \(s\) 中 \(0\) 替换成 \(r_0\)，\(1\) 替换成 \(r_1\) 后与 \(t\) 相同。 Solution. 设第一个串是 \(0\)，方便处理，\(1\) 同理Codeforces —— Check Transcription(1056E)
input 01 aaaaaa output 4 input 001 kokokokotlin output 2 题意： 给定一个划分0代表一个子串,1代表一个子串，问用01子串的方式来表示原串的01组合有多少种，并且01子串不能相同 思路 可以枚举首部的子串长度，然后用该长度可以计算出相对应的子串长度，对它们进行哈希，遇到不满足TALC: Transcription Aware Long Read Correction
TALC: Transcription Aware Long Read Correction TALC:转录组 意识 长读校正 Lucile Broseus, Aubin Thomas, Andrew J. Oldfield, Dany Severac, Emeric Dubois, William Ritchie doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.10.901728 Now published in Bioinf