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使用基因型数据计算近交系数
001、plink --het （纯合度近交系数） root@PC1:/home/test# ls outcome.map outcome.ped root@PC1:/home/test# plink --file outcome --het 1> /dev/null root@PC1:/home/test# ls outcome.map outcome.ped plink.het plink.log root@PC1:/home/test# head plink.het #[Typescript] Tuple type usage example
function flipCoin(): "heads" | "tails" { if (Math.random() > 0.5) return "heads" return "tails" } function maybeGetUserInfo(): | ["error", Error] | ["success", { name: string; email:1073. 负二进制数相加
1073. 负二进制数相加 给出基数为 -2 的两个数 arr1 和 arr2，返回两数相加的结果。 数字以 数组形式 给出：数组由若干 0 和 1 组成，按最高有效位到最低有效位的顺序排列。例如，arr = [1,1,0,1] 表示数字 (-2)^3 + (-2)^2 + (-2)^0 = -3。数组形式 中的数字 arr 也同样不含前导零：即 arrlinux中gzip解压文件并保留原始压缩文件
1、直接解压， 不保留原始文件 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls outcome.map.gz root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# gzip -d outcome.map.gz root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls outcome.map 2、解压并保留原始压缩文件 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls outcomlinux中如何删除^M符号
1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls outcome.map root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat -A outcome.map ## 末尾多出^M 1^Is64199.1^I0^I55910^M$ 1^IOAR19_64675012.1^I0^I85204^M$ 1^IOAR19_64715327.1^I0^I122948^M$ 1^IOAR19_64803054.1^I0^I203750^M$plink 软件中 --set-missing-var-ids 命令
plink中 --set-missing-var-ids 用于对缺失snpID的snp设定名称 1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls outcome.map outcome.ped root@PC1:/home/test# cat outcome.ped DOR 1 0 0 0 -9 G G C C G G G G A G A A G【路径规划】基于遗传算法求解多中心带时间窗车辆路径规划问题（VRPTW）matlab代码
1 简介 在分析时间窗的惩罚函数基础上,建立了带有时间窗的多配送中心车辆调度模型,针对模型设计了两阶段求解算法,先通过扫描算法把客户化分到不同的配送中心负责配送,然后采用遗传算法求解带有时间窗的多配送中心的车辆调度模型,最后,结合算例仿真计算验证了算法的有效性. 现有浅谈Java多线程之FutureTask
Runnable和Callable是多线程中的两个任务接口，实现接口的类将拥有多线程的功能，FutureTask类与这两个类是息息相关！ FutureTask继承体系 看下这张图，原来FutureTask类实现了Runnable和Future，既然是Runnable的实现类，我们可以写如下的代码： public static void main(String[] args) {R语言中实现plink --recode A指令
1、R实现 dat <- read.table("outcome.ped") name1 <- c("FID", "IID", "PAT", "MAT","SEX", "PHENOTYPE" ) name2 <- dat[,1:6] name3 <- rbind(name1, name2) dat <- dat[,-(1:6)] clinux系统shell实现统计 plink文件基因频率
1、 [root@centos79 test]# cat test.sh #!/bin/bash #step1 check consistence of columns temp1=`head -n 1 $1 | awk '{print NF}'` for i in $(seq `sed -n "$=" $1`) do temp2=$(sed -n "$i"p $1 | awk '{print NF}') if [ $linux系统shell实现统计 plink文件基因频率
1、 [root@centos79 test]# cat test.sh #!/bin/bash #step1 check consistence of columns temp1=`head -n 1 $1 | awk '{print NF}'` for i in $(seq `sed -n "$=" $1`) do temp2=$(sed -n "$i"p $1 | awk '{print NF}') if [ $linux系统中scp命令实现服务器之间数据的传输
linux系统中scp命令实现服务器之间数据的传输 1、从本地服务器传输至另一台服务器 测试服务器连通性： [root@centos79 test]# ifconfig | head -n 3 ## 查看本机服务器ip ens32: flags=4163<UP,BROADCAST,RUNNING,MULTICAST> mtu 1500 inet 192.168.3.83 netmask 255.Java 枚举类型
枚举类型 关键字enum可以将一组具名的值有限集合创建为一种新的类型，而这些具名的值可以作为常规的程序组件使用。 1、基本enum特性 ①values()方法返回enum实例的数组，可以遍历enum实例 ②ordinal()方法返回一个int值，这是每个enum实例在声明时的次序，从0开始 ③getDboost::outcome_v2::std_result用法的测试程序
boost::outcome_v2::std_result用法的测试程序 实现功能 C++实现代码 实现功能 boost::outcome_v2::std_result用法的测试程序 C++实现代码 #include <boost/outcome/std_result.hpp> #include <boost/leaf.hpp> #include <iostream> #plink软件计算位点杂合度和样本杂合度
杂合度计算分为两种：位点杂合度和样本杂合度 1、计算位点杂合度，测试数据如下: [root@centos79 test]# ls outcome.map outcome.ped [root@centos79 test]# cat outcome.map ## 8个snp位点 1 snp1 0 55910 1 snp2 0 85204 1 snp3 0菜鸟的学习笔记
菜鸟的学习笔记 **PART1** 数据处理**PART2** 代码报错 敲代码过程中遇到的许许多多的小问题。 PART1 数据处理 一、将两列拼接，即1和1变成11。( 参考了这里python合并两列) 首先读数据：df = pd.read_csv("data.csv")其次将要拼接的两列转化为字符串格式，很重要！怎么转化呢Go-directed and habitual learning
行为心理学 行为心理学由instrumental conditioning(operant conditioning)和respondent behaviors(classical conditioning; Pavlovian)共同构成。两者区别在于stimuli和response是voluntary 还是involuntary。 Classical conditioning 典型的代表是巴普洛夫的狗，中性条件（铃Java 枚举 enum 详解
本文部分摘自 On Java 8 枚举类型 Java5 中添加了一个 enum 关键字，通过 enum 关键字，我们可以将一组拥有具名的值的有限集合创建为一种新的类型，这些具名的值可以作为常规的程序组件使用，例如： public enum Spiciness { NOT, MILD, MEDIUM, HOT, FLAMING } 这里创建了一个名