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python中 pysam包FastxFile函数

  001、读取fasta文件 root@PC1:/home/test# ls a.fasta root@PC1:/home/test# cat a.fasta ## 测试数据 >Rosalind_1 ATCCAGCT >Rosalind_2 GGGCAACT >Rosalind_3 ATGGATCT >Rosalind_4 AAGCAACC >Rosalind_5 TTGGAACT >Rosalind_6 ATGCCA

python 中实现DNA一致性序列计算

  001、 root@PC1:/home/test# ls a.fasta test.py root@PC1:/home/test# cat a.fasta ## 测试数据 >Rosalind_1 ATCCAGCT >Rosalind_2 GGGCAACT >Rosalind_3 ATGGATCT >Rosalind_4 AAGCAACC >Rosalind_5 TTGGAACT >Rosalind_6 ATGCCATT >Rosa