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利用Nibabel包处理nii格式文件

参考程序: 查看和显示nii.gz文件 import matplotlibfrom matplotlib import pyplot as plt import nibabel as nib from nibabel import nifti1 from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D example_filename = 'data/PSE1.nii.gz' img = nib.load(example_filename) print(

SimpleITK 和 Nibabel 读取医学图像 nii 数据(2D显示)

SimpleITK 和 Nibabel 区别在于:(nii图像可以看成2维,也可以看成三维) SimpleITK读取数据是(X,Y,Z)显示,Nibabel读取图像是(Z,Y,X)显示,也就是Nibabel加载的图像会旋转90°,其中X表示通道数,即切片层数。详情  import SimpleITK as sitk import skimage.io as io def read_img(path): img

如何从MRI图像中删除模态 – Python Nibabel

我正在尝试将MRI脑成像数据用于深度学习模型.目前我的图像有4个尺寸,如下所示,但我只想保留MRI图像的T1c模态,因为我的模型输入应该只是1通道3D MRI(T1c). 我确实尝试使用Nibabel包,如下所示 import nibabel as nib ff = glob.glob('imagesTr\*') a = nib.load(ff[0]) a.shape