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易基因|植物中m6A甲基化酶调节机制:组成、功能和进化

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。   N6‐methyladenosine也就是我们平时所说的m6A甲基化修饰,是RNA最关键的内部修饰之一,是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。这种修饰在植物中的范围和功能一直是研究的热点,特别是在模式植物系统

20、第3次做蛋糕卷【抹茶味的哦】

这次刚好买的抹茶到货了,然后就想做一个抹茶味的蛋糕卷, 上次的小三卷做的还可以,所以这次也是小三卷的材料,然后抹茶粉就加了一点,没量多少, 步骤和小三卷一样,第一次150°烤40分钟,然后发现下面不熟,然后再用上层140°,下层180°烤了10分钟。 优点: 1、小三卷的比例量的很精准,都是30g。 2、

NVT模拟时出现水分子空洞

density盒子收缩的原理:     蛋白和水盒子叠合的过程中,是有个范围内没有水的,这个空间是空的,但跑起来以后,水分子会渗入进去,于是水就不够了,盒子有部分就变成真空了。   水盒子要加厚:       越大的体系,一开始水盒子得加的越厚,因为有空隙会收缩,需要保证收缩后仍大于cutoff值+2A,否

蛋白质统计偶联分析(Statistical coupling analysis,SCA)---模块一报错问题解决

           蛋白质中氨基酸位点之间的偶联对其功能和结构非常重要,如果采用生物信息学的方法进行氨基酸位点的偶联分析,可以克服传统生物学实验方法难以从宏观角度进行系统的功能分析的局限,这就是所谓的蛋白质统计偶联分析(https://ranganathanlab.gitlab.io/pySCA/SCA

牛血清白蛋白BSA:蛋白定量检测标准品

牛血清白蛋白,英文名称Bovine Serum Albumin(BSA),也称Cohn Fraction V,即第五组分(第五组分并不是BSA的一种组份,而是Edwin J.Cohn教授早期从血液中通过特定的分离技术得到5种组份,其中第五种就是白蛋白)。 牛血清白蛋白BSA作为牛血清中的一种白蛋白,包含583个氨基酸残基,分子量为66

课程笔记

1.如何下载基因组gff3文件 https://itol.embl.de/ ensembl plant -download- 2.提取cds序列 需要两个文件 ①基因组序列文件:序列 ②基因结构注释文件gff3:序列对应的结构 TBtools:GXF Sequences Extracter 首先把gff文件拖进去,初始化,选择CDS、parent,拖进去基因组序列文件,输入输出

2021蛋白组学研究常用数据库汇总整理

蛋白质组学产生于20世纪90年代,是以生物体的全部或部分蛋白为研究对象,研究一个生物、一个细胞(组织)或基因组的蛋白质的变化规律的一门学科。 蛋白质组学能够在整体水平上研究蛋白质的表达、调控的水平和规律,目的是了解蛋白质间的联系与相互作用,为生命活动规律提供理论和物质基

Magarose-NHS,NHS活化琼脂糖磁珠,NHS琼脂糖微球预活化的琼脂糖磁性微球

NHS 活化的琼脂糖磁珠(Magarose-NHS)将蛋白质简单有效地共价固定到磁珠载体上,为抗体、抗原或其他生物分子的亲和纯化提供了有价值的方法。活化的琼脂糖磁珠含有能够与蛋白质或其他分子上的伯胺反应形成稳定的酰胺键的 N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)官能团。耦合反应在 pH 7~9 的无胺缓冲液

全球及中国水解蚕丝蛋白行业研究及十四五规划分析报告

【报告篇幅】:122 【报告图表数】:166 【报告出版时间】:2021年1月   报告摘要 2019年,全球水解蚕丝蛋白市场规模达到了xx亿元,预计2026年可以达到xx亿元,年复合增长率(CAGR)为xx%。中国市场规模增长快速,预计将由2020年的XX亿元增长到2027年的XX亿元,年复合增长率为XX%(2020-2026)。 本

细胞生物学名词解释

群文件,大量资料,自行下载 群内定期发送旗舰店好货,记得开启免打扰和置顶 正在跳转 名词解释题 细胞:是生命体活动的基本单位。 原位杂交:确定特殊的核苷酸序列在上染色体或细胞中的位置的方法称为原位杂交 脂质体:根据磷脂分子可在水相中形成稳定的脂双层的趋势而制备的人工膜。单层

2021-2025年中国合成蛋白行业市场供需与战略研究报告

合成蛋白市场的企业竞争态势      该报告涉及的主要国际市场参与者有AgriProtein、Aspire Food Group、Enterra Feed Corporation、EntoCube、Entomo Farms、Global Bugs Asia Co., Ltd.、Proti-Farm Holding NV、Protix、Tiny Farms、Ynsect等。这些参与者的市场份额、收入

A deep-learning framework for multi-levelpeptide–protein interaction prediction文章梳理

作者:清华大学的曾坚阳老师团队 期刊:Nature Communication 时间:2021.9.15 0写在前面的疑惑  1)模型中,三个分类通道有一个分支将输出结果给与数字通道,目的是什么? 1动机 多肽通过与多种蛋白质相互作用并参与许多细胞过程,如程序性细胞死亡、基因表达调控和信号转导,因此,多肽在人类生

与多种疾病相关的PROTAC分子研究

蛋白降解靶向嵌合体(Proteolysis-Targeting Chimeras, PROTACs),是一种新的具有良好前景的药物类型,其结构类似于哑铃,通过一个连接子(linker)连接 “靶蛋白的配体”以及“E3泛素连接酶的招募配体”。换言之,PROTAC分子的一端与兴趣靶蛋白结合,另一端与E3泛素连接酶结合。而E3泛素连

上了年纪的人得了帕金森,该怎么缓解?

帕金森医学上称为帕金森病,危害包括以下方面: 1.容易引起运动能力、协调能力下降,导致生活中与运动相关的能力受限,甚至容易出现跌倒 2.帕金森病患者可出现抑郁,影响患者生活、情绪还有感情,后期可出现痴呆,表现为认知障碍 3.其它,如出现疲乏、无力、疼痛、情感淡漠、便秘、大小便障碍

人工智能新药设计新药化合物筛选新药发现

人工智能新药设计新药化合物筛选新药发现专题 新药研发存在周期长、费用高和成功率低等特点,人工智能作为药物研发领域的一个热点方向,已被应用到药物研发的各个阶段,医药领域对人工智能技术越来越重视,目前人工智能技术在药物研发中的应用主要表现为七个场景,分别是:靶点药物研发

CADD计算机辅助药物设计系列专题与分子动力学模拟在线直播实例

CADD计算机辅助药物设计系列专题与分子动力学模拟: 1、本次计算机辅助药物设计系列共分三个专题,《基础:CADD专题》、《进阶:先导化合物筛选专题》、《进阶:薛定谔专题》。 3.本次分子动力学模拟系列共分两个专题,《Gromacs分子动力学模拟》《Amber分子动力学模拟》。 CADD专题 生

基因家族分析-蛋白互作网络分析

与拟南芥同源比对,映射同源关系 https://orthovenn2.bioinfotoolkits.net/home 用拟南芥的蛋白互作网络映射自己物种蛋白质互作网络 https://string.db.org/ 网络图美化 https://cytoscape.org/

第九章 生化遗传学

第九章  生化遗传学 生化遗传学(biochemical genetics)是利用生物化学的原理和方法来研究遗传物质的理化特性,探讨遗传物质(基因)与遗传性状之间的代谢联系,从而阐明基因的基本功能及其调控过程;与之相应的是这一学科也为揭示由于基因突变而引发的代谢缺陷(或相关的疾病)提供了理论依据

《初入实验室的学问与技巧》第二讲《设计且完成一个课题》

禁止转载 一、设计课题的原则 课题的确定和开题报告 自己命题导师帮助研究生命题导师给研究生题目参与师兄师姐的课题联合培养等 重点是无论怎么命题,都要把现在的题目高高兴兴完成了。 二、读文献 本实验室的文献:特别是近三年的与自己研究课题密切相关的文献根据自己的特点和能

测序技术的学习

一、chip-seq(研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法) 一个染色质 1、调控染色质形态:组蛋白修饰、染色质重塑、DNA甲基化 2、作用机制 1、用交联剂,把与DNA互作的蛋白固定住,防止在两到三天的实验中,从染色质上脱落 2、用抗体识别并结合染色质上的靶蛋白 3、纯化富集靶蛋白 4、靶蛋

【干货】李雪明:冷冻电子显微技术的分辨率革命与未来发展

本讲座选自清华大学生命科学学院李雪明研究员于2015年11月26日在 RONG v2.0---图形图像处理与大数据技术论坛上所做的题为《冷冻电子显微技术的分辨率革命与未来发展》的演讲。李雪明:首先感谢RONG系列交流会的组织者邀请我来这里做一个报告。我们现在做冷冻电子显微学的技术,大家通

慢性肾脏病蛋白营养治疗专家共识

更新:目前国际上的观点认为即使在慢性肾脏病4-5期,患友每日蛋白入量也不应低于0.6-0.8 g/ (kg•d)。其他内容仍然有借鉴价值。   近年来,全球终末期肾病患病率持续增长。这与人口老龄化、能够引起肾损害的疾病(特别是糖尿病) 的发病率增加以及透析治疗的普及有关。治疗终末期肾

不得不知道的Western blot内参知识

β-Actin与GAPDH内参真的那么靠谱吗?哪种内参最靠谱?免疫印迹(Western blot, WB)是分子生物学中检测复杂生物提取物中特定蛋白质存在的最常用方法之一。WB必须控制上样量以确保目标蛋白变化具有可比性,通常选择在所有组织中普遍分布的具有相对恒定量的蛋白质作为内参(Loading control)。内

科研新人​细数那些常用分子互作实验

浅显易懂的分子互作实验原理酸菜校长的36策让我们进入了科研的大门,老谈老师的24型让我们初次具体领略表型的标。临床医生做科研,本就比“专业选手”起步晚,基础科研还那么难,想要产出这个“时代的产物”就更难了。而目前高分杂志对于文章的创新性和机制深度的要求越来越高,更是让我们望

​什么叫热点?结论相反也能双双上顶刊!

大牛之间的碰撞对于当今的生物类科研领域而言,相变可谓是炙手可热的研究方向,但凡跟相变沾点儿关系的论文几乎都发在不错的期刊上。如果相变算是新近涌现的大热点,那么Hippo通路则可称得上已然纵横江湖十几载的持续大热点。如果两个大热点碰撞在一起会怎么样?用脚后跟想,都知道会是大热