代谢组学数据分析及网络药理学结构案例分析推荐

20世纪40年代末期，Roger Williams等人首次提出代谢谱，并采用纸色谱法研究尿液中代谢物与精神分裂症的关系。到了20世纪80年代末期，Nicholson的研究小组利用核磁共振技术分析了大鼠的尿液,并于1999年提出了代谢组学的概念。自此代谢组学进入了飞速发展的阶段，并在现代生物学研究中发挥了越来越重要的作用。到了2019年，代谢组学相关文章的发表量超过了五千篇，由此可以看出代谢组学在科学研究中举足轻重的作用。
要了解代谢组学，首先就先看代谢组学到底是什么？
代谢组学是生物体被扰动后（如基因改变或环境改变），通过对生物体内所有小分子代谢物进行定性定量分析，发现其代谢物种类/数量及其变化规律，并寻找代谢物与生理病理变化相对关系的科学。其研究对象大多是分子量在1000Da以下的小分子物质，如糖、有机酸、脂质、氨基酸、芳香烃等。目前，代谢组与基因组、转录组、蛋白组是系统生物学的重要组成部分，四大组学也为我们从微观到宏观层面充分了解一个生命体架起了一座桥梁，解释了生命体从微观DNA分子到分泌小分子代谢物的整个变化过程。

代谢组学数据分析及网络药理学研究技术与实践课程
一、代谢组学研究技术与实践
1、代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨
1.1 代谢组学概述
1.2 代谢组学操作流程
1.3 样本的采集、储存与制备关键问题
2、代谢组学数据采集与预处理，决定数据统计结果的准确性
2.1 常用技术平台介绍（NMR和LC-MS）
2.2 常用软件和数据库介绍（代谢物鉴定、数据预处理与分析）
2.3 数据预处理，包括数据归一化、标准化和数据转化以及缺失值评估等
3、基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操
3.1 样本分类（无监督和监督模式）
3.2 差异变量筛选（S-plot、S+V-plot、VIP、biplot等）
3.3 常见图形结果解读
二、网络药理学研究技术与实践
4、网络药理学研究思路和流程
5、网络药理学数据分析与实操
5.1 化学成分的获取与筛选（Pubchem、TCMSP数据库、TCMID数据库、Swiss ADME数据库等）
5.2 中药化学成分靶点获取（TCMSP数据库、BATMAN-TCM数据库、Similarity Ensemble Approach (SEA)数据库、HitPick数据库、Swiss Target Prediction数据库等）
5.3 疾病靶点富集数据库（DisGeNET数据库、GeneCards数据库、OMIM数据库等）
5.4 化合物与疾病靶点映射（韦恩图）
5.5 PPI网络分析（PPI网站的构建、PPI核心网络的筛选）
5.6 富集分析（DAVID数据库、Metascape 数据库）
5.7 网络图构建—Cytoscape（数据导入、节点关系的建立、节点属性计算、调整网络样式、筛选及过滤、网络图导出）
三、代谢组学与网络药理学结合研究技术与实践
6、代谢组学与网络药理学结合研究思路
7、代谢组学与网络药理学结合分析技术
7.1 代谢组学与网络药理学数据的获取（HMDB数据库、成分靶点获取、疾病靶点富集数据库、 代谢专属数据库）
7.2 代谢组学功能分析（富集分析、通路分析等）
7.3 代谢小分子网络关联分析（Metscape软件、KEGG数据库、OmicsNet数据库）
7.4 代谢组学与网络药理学功能层次关联分析
四、文献解读及实例解析
8、文献解读：代谢组学与网络药理学结合的文章分析流程和套路
8.1 中药化学成分靶点与代谢小分子网络分析实例
（Food Res Int. 2020, 136:109503）
创新点：采用Metscape软件对代谢组学发现的差异代谢物和中药成分的药物靶点关联，聚焦关键蛋白。

8.2代谢组学与网络药理学功能层次关联分析实例
（J Ethnopharmacol. 2021，264:113281. ）
创新点：采用功能富集工具分别对网络药理学和代谢组学数据进行关联，聚焦关键通路。

8.3代谢组学和网络药理关联分析实例
（Comput Struct Biotechnol J. 2021, 19:1002-1013）
创新点：整合代谢组学和网络药理学揭示羟基红花黄色素A抗急性脑外伤的作用机制损伤。

9、实例解析与练习
9.1 TCMSP数据库获取与筛选化学成分
9.2 Swiss Target Prediction数据库预测成分靶点
9.3 DisGeNET数据库获取疾病靶点
9.4 化合物与疾病靶点映射
9.5 PPI网络绘制
9.6 DAVID软件进行富集分析
9.7 Cytoscape工具绘制成分-靶点图
9.8 Metscape绘制代谢-酶网络关联图

七、联系方式：
咨询电话：15076991162 联 系 人:胡老师
报名邮箱：hh247150@163.com 报名QQ/微信: 1047608967
官方网址：www.hdpaii.com 官方座机：010-56245524
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问题1：课程讲师是否专业？
本次课程由工作在科研一线的硕士生导师担任主讲，在国内外学术期刊发表研究论文20余篇，其中SCI收录超过10篇。近几年主持/参与国家自然科学基金和省自然科学基金多项。从事代谢组学技术研究近十年，熟练相关操作流程和数理统计方法，研究方向为基于代谢组学技术的中药质量控制及药理研究。
问题2：课程是否适合小白/零基础的学员？
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问题3：通过代谢组学数据分析及网络药理学研究技术与实践培训班我能学到什么？
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标签：数据分析,药理学,组学,代谢,数据库,网络,靶点
来源： https://blog.csdn.net/YHJX57/article/details/117112021