Planetoid无法直接下载Cora等数据集的3个解决方式

三个解决方式简介：

1. 修改raw.githubcontent.com在hosts中对应的IP地址
2. 手动从GitHub或gitee下载数据，放到对应文件目录位置；或者用Python拉数据下来
3. 修改torch_geometric源代码

以下是对这些解决方式的详细介绍（仅以Cora为例，其他数据集不再赘述）：
如果顺利的话，应该只需要执行类似这样的代码即可在对应根目录位置下载数据集：

from torch_geometric.datasets import Planetoid
dataset = Planetoid(root='./tmp/cora', name='Cora')

Planetoid文档：https://pytorch-geometric.readthedocs.io/en/latest/modules/datasets.html#torch_geometric.datasets.Planetoid

在planetoid源代码中可以看到，这个类的大致逻辑就是从GitHub下载数据→处理数据。出现无法下载的情况时可能是由于Planetoid从raw.githubcontent.com这个域名下载数据，而这个域名在电脑上被DNS污染。
本文仅考虑这种情况造成的无法下载情况。如果您发现您的机子没有这种问题，那么您可能无法通过本文的手段解决对应的问题。

解决方式一： DNS
可以通过ipaddress.com这个网站获取raw.githubcontent.com对应的IP地址，然后修改hosts，就可以直接下载。
直接挂代理一般也可以解决问题。

解决方式二： 从GitHub或gitee拉数据
一种做法是手动从GitHub或gitee下载数据。
GitHub项目是https://github.com/kimiyoung/planetoid，gitee项目是https://gitee.com/jiajiewu/planetoid。gitee的话在国内会更快点，所以推荐用gitee的。
gitee可以直接在网页上下载单个文件。直接修改网址也可以下载单个文件，具体网址见下面用Python下载数据部分。此外也可以通过git clone的方式把整个项目拉到本地。
GitHub通过插件或者修改网址也可以下载单个文件，但是如果你能通过这种方式下载文件，你的DNS应该没有被污染。
具体需要的数据是这些：

第二种做法是用Python下载对应的文件。
直接把这个网址输到浏览器里面也能下载就是了……
我使用的是这个方式。主要原因是我在服务器上跑的项目，直接把所有事都在Python代码里解决就会比较方便。
base_url参数：
推荐使用gitee的：https://gitee.com/jiajiewu/planetoid/raw/master/data/ind.cora.
github的话可以二选一：https://github.com/kimiyoung/planetoid/raw/master/data/ind.cora.或https://raw.githubusercontent.com/kimiyoung/planetoid/master/data/ind.cora.（但问题在于如果你能从这两个网址拉数据……那你……就不应该有不能下载的问题）
注意，这里要通过raw下载数据，如果直接用网页下载数据（如https://gitee.com/jiajiewu/planetoid/blob/master/data/ind.cora.allx）的话就会下载成网页……我一开始就下载成了网页……这肯定是会报错的。要下数据文件。
可以尝试使用PyG的download_url()方法下载数据（这是源代码中使用的方式）。其文档地址。
我使用的是requests。别的方式应该也行，就各种直接下载网页文件的方式应该都行。我这里给一个代码：

import requests

names = ['x', 'tx', 'allx', 'y', 'ty', 'ally', 'graph', 'test.index']
for name in names:
	file_url=base_url+name
    r=requests.get(file_url)
    with open('./tmp/cora/Cora/raw/ind.cora.'+name, 'wb') as f:
        f.write(r.content)

通过以上两种方式任一来下载需要的数据后，将其放到根目录下Cora/raw文件夹下，然后再运行dataset = Planetoid(root, name='Cora')。如无报错并显示如下输出则成功。

Processing…
Done!
Cora()

解决方式三：把planetoid.py里面第48行的 url = 'https://github.com/kimiyoung/planetoid/raw/master/data' 改成 url='https://gitee.com/jiajiewu/planetoid/raw/master/data'
逻辑上就跟第二种解决方式里面从gitee拉数据一样。

参考资料：

1. 【PyG学习入门】二：入门时遇到的问题
2. Cora数据集不能下载
3. 用torch_geometric无法下载Cora数据怎么办？
4. torch_geometric下载数据集Cora时报错

标签：Cora,Planetoid,planetoid,gitee,raw,com,下载
来源： https://blog.csdn.net/PolarisRisingWar/article/details/116399648