Seurat3.0小提琴图腰围的参数
作者:互联网
小提琴图没有有些群没有出现小提琴只有点点,是由于0值比例太多,
一个关键的参数scale = "width"导致了这种局面,应加上上述参数
ggplot(p$data,aes(ident,CD4)) + geom_violin(scale = "width", adjust =1, trim = TRUE) + geom_jitter()+ theme_bw()
adjust参数可以调整腰的粗细,eg:
ggplot(p$data,aes(ident,CD4)) + geom_violin(scale = "width", adjust =.5, trim = TRUE) + geom_jitter()+ theme_bw()
我们如何画出都有小提琴的小提琴图呢?也许可以用的方法之一就是,数据过滤。
VlnPlot(subset(pbmc3k.final,CD4 > 0 ), "CD4")+ theme_bw()
改腰围:
VlnPlot(subset(pbmc3k.final,CD4 > 0 ), "CD4",adjust = .2)+ theme_bw()
标签:小提琴,adjust,腰围,Seurat3.0,CD4,theme,bw,geom 来源: https://blog.csdn.net/Demomwu/article/details/115023809