爬虫获取pubmed中文献的标题和摘要

为了满足快速浏览pubmed中相关文献标题和摘要的需求，写了个简单的爬虫（目前只实现了单个关键词以及多个关键词的and检索），用于批量获取感兴趣文献的标题和摘要。

使用编辑器是python，所编写的爬虫主要使用requests模块+正则表达式。使用requests.get()来获取请求，使用re模块中re.compile(正则表达式).findall(请求)来获取标题和摘要。代码中对浏览器进行了伪装，但是就只用了2个浏览器。

import requests
import re
key=input("请输入你想查找的信息：")
local_url=input("请输入你想存储的位置及名称：")
turl="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/"
tdata=requests.get(turl,params={"term":key}).text
pat_allpage='<span class="total-pages">(.*?)</span>'
allpage=re.compile(pat_allpage,re.S).findall(tdata)
num=input("请输入大致想获取的文章数目（总数为"+str(int(allpage[0].replace('\n        ','').replace(',',''))*10)+"):")
for j in range(0,int(num)//10+1):
    url="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/"+"?term="+key+"&page="+str(j+1)
    data=requests.get(url,params={"term":key}).text
    pat1_content_url='<div class="docsum-wrap">.*?<.*?href="(.*?)".*?</a>'
    content_url=re.compile(pat1_content_url,re.S).findall(data)
    hd={'User-Agent':'Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; Win64; x64; rv:76.0) Gecko/20100101 Firefox/76.0','User-Agent':'Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/70.0.3538.25 Safari/537.36 Core/1.70.3741.400 QQBrowser/10.5.3863.400'}
    for i in range(0,len(content_url)):
        curl="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/"+content_url[i]
        try:
            cdata=requests.get(curl,headers=hd).text
            pat2_title="<title>(.*?)</title>"
            pat3_content='<div class="abstract-content selected".*?>(.*?)</div>'
            pat4_date='<span class="cit">(.*?)</span>'
            title=re.compile(pat2_title,re.S).findall(cdata)
            print("正则爬取的题目是："+title[0])
            content=re.compile(pat3_content,re.S).findall(cdata)
            date=re.compile(pat4_date,re.S).findall(cdata)
            fh=open(local_url+".html","a",encoding="utf-8")
            fh.write(str(title[0])+' ----'+str(date[0])+"<br />"+str(content[0])+"<br /><br />") 
            fh.close
        except Exception as err:
            pass
        if int(num) < 10:
            if i+1 == int(num):
                break
        elif int(num) == 10:
            if i == 9:
                break
        elif (j*10)+i+1 == int(num):
            break

将上述代码保存为.py格式，进入终端运行代码：

python 文件名.py

输入关键词（target%3bmutation）、保存路径及名称（G:\爬虫学习\drug_mutation）、想获取的文章数（7）：
#多个关键词需要使用分号分隔，在输入中需要将分号改为‘%3bmutation’

得到.html格式的文件：标题----时间 摘要

遇着的问题：

1.在运行程序时会出现错误，再次运行错误就会消失；（可能是网络问题，也有可能是访问太多次被拒，过段时间再运行即可）

2.速度有点慢；（可能是网慢，导致请求返回的比较慢）

未来进行改进的地方：

1.点击标题可以对该文章进行下载；2.确定输入不为整数的文章数时，少用if语句；3.可以对文章发布时间进行选择；4.除了实现and的检索，还能实现or、not的检索

刚开始研究爬虫，有什么建议，欢迎提出来！有不懂的，一起探讨！

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来源： https://blog.csdn.net/qq_40270119/article/details/106503093