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实验记录 | 8/6 文献阅读

作者:互联网

今天的主要任务:
(1)读两篇文献,反正接下来的时间就是等待。还不如让这个等待的时间更加充实一点。
(2)QC,还是要看一下数据的基本情况,看看拆分的对不对?
(3)生信技能树上推荐的那篇smart-seq和10X数据的区别,如果只是测序UMI,那可能我的分析思路就有问题了。
(4)看一下作者拆分的代码。我想还是跟我想象的有区别的,只有熟悉了它是怎样拆分的,才能保证这个结果的出现是在你的预期之内的。
(5)整理bioart公众号上关于祖细胞的那篇文章。

今天想做的事情还是挺多的。而且现在情绪正常,心情愉悦,有很好的精神状态做自己想做的事情。


(16:25)纠结了一下午,最终还是选择血液组织的谱系发育的这篇paper来进行阅读。
在这里插入图片描述
选择理由如下:
(1)这篇文章主要研究的论题也是利用突变的信息,构建细胞的谱系发育的关系(暂时这样理解,具体的细节我还不太清楚)和我现在的问题有一定的相关性,虽然研究的不是大脑而是血液组织,扩展一些视野也是挺好的。看看这个问题能够研究到什么样的程度,可以用一些怎样的实验方法。
(2)这篇文章很新(5月),发表在nature上,作者们都很厉害,我想要学习他们的idea。
(3)篇幅适中,没有那么多恶心的图。虽然方法部分依旧有很多。

(21:17)把主要的结果和discussion看完了。大脑受到了一点点的熏陶。现在学习的热情特别大,觉得自己有很多不会的。有很多想要探索的东西。脑袋里有很多的想法,虽然乱七八糟的。等到我的那个数据跑完了,我挨个的验证和整理一下。对于周末的安排。
(1)周六继续看文献,积累储备对于这个问题的思路。
(2)周日整理结果,进行想法的简单的尝试。准备汇报的内容。

现在我还有40分钟的学习时间(我还不想回去)。
(1)我想看一下10X的双端150bp的测序方法的基本原理。以及王老师在文章中是如何使用10X的数据的,因为我现在遇到了一些问题,我就比较好奇。==>我觉得问题的来源在于,我对于这个数据的理解还不够,所以对于怎样更好的分析他,心里没有很好的把握。
(2)整理一下胚胎发育过程的思维导图。把重要的英文单词标注出来,学习。

标签:记录,一下,测序,10X,实验,篇文章,拆分,整理,文献
来源: https://blog.csdn.net/weixin_40640700/article/details/119446146