生物数据库开发工具GMOD全家桶

GMOD（Generic Model Organism Database） 是专为生物学家创建的开源项目，生物学家用作存储库和工具的交互应用程序和数据库的集合。

连通性是GMOD的关键。生物信息学应用程序和数据库大量产生，但其中许多工具很少使用，因为用户可能缺乏将工具连接到他们数据所需的资源或专业知识。GMOD 通过提供存储数据的方法和一整套用于操作该数据的工具来填补这一空白。

GMOD 有专门的社区。许多 GMOD 组件是成熟的软件，背后有很多人多年的软件开发经验。软件开发人员、科学家和实验室每天使用或改进这些组件的。自从基因组序列开始出现并且许多第一个基因组数据库使用 GMOD 组件以来，对此类软件的需求一直很强劲。GMOD 数据库和软件组件随着基因组项目的大规模增长和发展以及用户需求的变化而扩展。

GMOD 也是安装在计算机上的特定东西。它可以是学生最新数据的私人查看器，可以是在中心实验室多年开发的 TB 级数据库和 Web 应用程序套件，可以是一个通过脚本访问的实验数据数据库，也可以是您用来描述的基因组注释工具。

GMOD套件中，包括基因组注释、比较基因组可视化、数据库架构、基因组可视化与编辑、基因表达可视化、文本挖掘、分子通路和本体可视化、工作流程管理以及前端等工具。其中有很多我们耳熟能详的生信工具，如JBrowse、GBrowse、Galaxy、biomart、Maker、Tripal、InterMine等，最难得的是这些组间之间是连通的，可以相互调用，真的非常强大！

GMOD全家桶列表，进去浏览一下，选择合适的工具。

标签：数据库,基因组,开发工具,可视化,GMOD,组件,工具
来源： https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/16652150.html