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perl 小练习

作者:互联网

1.以scaffold.fasta作为输入文件,计算GC含量以及N50和N90

2.根据给定的基因组scaffold.fasta文件和相对用的基因注释gff文件提取基因的cds区域,并以每行60个碱基的格式输出到cds.fasta文件中

3.以cds.fasta作为输出文件,将其翻译成蛋白质序列并以每行60个氨基酸的格式输出到pep.fasta文件

标签:文件,输出,scaffold,练习,perl,60,cds,fasta
来源: https://blog.csdn.net/Cassiel60/article/details/104812804