python – 如何迭代DNA代码串中的每个[：2]重叠字符？

假设我有一串DNA’GAAGGAGCGGCGCCCAAGCTGAGATAGCGGCTAGAGGCGGGTAACCGGCA’

考虑前5个字母：GAAGG

我想用一些与它们发生的可能性相对应的数字替换每个重叠的二元组’GA’,’AA’,’AG’,’GG’,将它们相加.像’GA’= 1,’AA’= 2,’AG’= .7,’GG’= .5.所以对于GAAGG,我的sumAnswer = 1 2 .7 5.

所以在pseduo代码中,我想……
– 在我的DNA字符串中的每个重叠的二元组中
– 为每个唯一的二元对找到相应的值
-sum每个值迭代

我不是很确定如何迭代每一对.我认为for循环可行,但不考虑重叠：它打印每2对(GAGC = GA,GC),而不是每个重叠的2对(GAGC = GA,AG,GC)

for i in range(0, len(input), 2):
      print input[i:i+2]

有小费吗？

解决方法:

只需在你的范围内省略2,并确保不到达你的字符串的最后：

for i in range(0, len(input)-1):
    print input[i:i+2]

,2告诉Python在每次迭代时前进两步.通过将其删除,您默认为前进一个.

标签：python,iterator,for-loop,string,n-gram
来源： https://codeday.me/bug/20190715/1467695.html