8分期刊上miRNA与疾病研究的另一个招式

小鹿在前面的文章《不会研究疾病？来点简单的临床SNP套路》里给大家介绍miRNA的SNP的临床研究范式，主要研究的是miRNA的SNP与临床因素的相关性。今天给大家介绍的是miRNA的SNP的基础实验研究范式啦！

我们都知道miRNA是一种长度为21到23个核苷酸的RNA分子，当它结合到mRNA的3'UTR区，从而促进mRNA的降解，调控基因的表达。但是当miRNA有一个或者两个碱基发生变异时，miRNA是否还能发挥正常的调控功能，这个就很难保证了。毕竟从miRNA就那么长，一个碱基就占了大约5%了。既然存在不确定，那么就需要我们去研究啦。
首先先给大家介绍一篇2009年发表在 Cancer Research 上的一篇文章，文章虽然老，但不妨碍我们学习了解研究的思路，而且可以站在新时代的角度继续发展嘛。

首先，他们发现了一个miRNA的碱基突变与乳腺癌的病人生存预后是相关的，OR <1，说明miRNA的SNP是个保护因素，而位于miRNA上游CpG区域的高甲基化，也就是说当这个miRNA低表达时是个保护因素，毕竟高甲基化会降低表达嘛。
因此，合理推测这个miRNA有可能是个搞事情的oncogenic role。这里笔者要吐槽的是，研究人员在table的下面表明研究校正了多种因素，但校正的太多了，因为一般而言校正的因素不能超过样本量的10%，也就是6个左右，但这里多达8个。

然后研究人员将野生型（miR-196a）和SNP型（miR-196a*）转染到细胞内，Precursor的两个柱子表示转染成功，两种类型的miRNA转到细胞内的量都相近。然后检测转录野生型miR-196a的时候，pre-miR-196a-C的量很高，而pre-miR-196a-T相对低很多。说明野生型的miR-196a才是成熟的产物。

然后研究人员用IPA展示了miRNA影响的基因的网络图。IPA，那可是比KEGG牛逼多少倍的存在啊，2019年了，我们都还用不起，人家10年前就用上了，有钱真好。

接下来作者展示了野生型基因的差异表达情况，可以清楚的看到很多野生型也可以影响调控的基因，SNP型就不能影响了，说明miRNA上碱基的保守性对于基因表达的调控真是非常重要了！

文章的最后研究人员展示了野生型和SNP型对细胞周期的影响。

整篇文章就这么区区几张图，站在2019年来看这篇2009年的文章，那真是水到不行，毕竟大家的科研水平都提高了嘛。不过我们还是可以学到思路是：我们可以先找到并检验miRNA的SNP，然后检验下游基因的变化，从而影响细胞的功能变化，如何做下游的机制呢？显然又回到了酸菜教给大家的研究miRNA和基因的套路上来了。
但巧妇难为无米之炊啊，miRNA的突变怎么找呢？别着急，我们马上会给你介绍个神器的！

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