10X genomics|cell base|in-vivo based|model organisms|SBI|

生命组学-药物基因组学

精准医学的内容有个人全基因组测序，移动可穿戴设备，它可以实时监测，深度学习模型预测疾病，对疾病预测做到有效、安全和可控。

药物基因组学就是研究疾病、化合物和靶点之间的关系，关键是找到能控制疾病的蛋白质结合腔。

遗传性疾病可通过家系研究，非遗传性疾病可通过GWS找突变位点，基于突变情况找治疗方法。SBI是结构生物学与药物分子设计与生信相结合的学科。

药物制造的传统问题是不知道潜在的药物靶标，针对某一症状而不是疾病，广泛测试得到小分子，最后再调整基团，效率极低。

现代的药物基因组学是通过疾病相关序列找到靶标，根据靶标设计小分子，在优化阶段，可使得药物小分子变小，避免毒副作用，毒副作用就是与其他蛋白结合并影响功能，提高准确性，准确性就是分子与靶标结合程度。

鉴定药物靶标的方法是首先通过查询gene expression差异、蛋白质组信息（该方法准确率更高），蛋白质调控网络，遗传家系研究来找寻线索。通过比对数据库中的相似序列找target gene或者调控网络，找到靶标后分子优化。分子优化要同时结合个体差异性和个体基因组差异性，此时可以利用reference genome，比如为亚洲人制药就使用亚洲人的reference genome，最后利用cell base、in-vivo based、model organisms方法来验证靶标。

个体基因组研究在sequence阶段使用30X最好，10X genomics有比较好的效果。

10X genomics：chromium segregates samples into individual microwells, where DNA in each well can be labeled with a unique barcode sequence. The process recovers information that is normally lost when scientists cut DNA into short fragments as part of sample preparation for the leading DNA sequencers

标签：分子,genomics,based,organisms,药物,靶标,10X,疾病
来源： https://www.cnblogs.com/yuanjingnan/p/11667789.html