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Population Genomics Provide Insights into the Evolution and Adaptation of the Eastern Honey Bee (Api

作者:互联网

1、文章网址

https://academic.oup.com/mbe/article/35/9/2260/5040667#supplementary-data

2、Abstract

生物适应变化环境的机制是进化生物学中的一个基本问题,对保护重要物种应对气候变化具有重要意义。研究这个问题的一个有趣的候选对象是蜜蜂Apis cerana,它是一种重要的传粉者,广泛分布在各种各样的气候中,表现出迅速的传播。在这里,我们重新测序了18个群体中的180个A. cerana个体。利用群体基因组学方法,我们观察到中蜂有相当大的遗传变异(注,FST?)。遗传分化模式在亚种水平上表现出高度的分化(注,FST?),而种群分化的驱动力不是距离,而是物理屏障(注,如何确定?)。分歧时间的估计表明,主要分支的分歧在300 - 500 Ka之间。对种群历史的分析表明,由于在较暖的时期观察到种群数量的增加,地球气候对中蜂的有效种群数量有很大的影响。进一步分析了自然选择下的候选基因,这些基因可能与蜜蜂的认知、温度适应和嗅觉有关。根据我们的研究结果,A. cerana在应对气候变化方面可能有很大的潜力。我们的研究为中蜂的进化和适应提供了基础知识。

3、Introduction

 

4、Results

我们从18个种群中抽取了180个个体作为样本。全基因组重测序了361 Gb的测序数据。基因组比对的平均深度为7.8X。经过质量控制,我们总共鉴定出267万个单核苷酸多态性,其中144,673个位于外显子区,27,947个位于非同义突变区。

4.1、Population Structure

我们首先使用ADMIXTURE(Alexander et al. 2009)进行聚类分析,来检查群体间的关系。

 

标签:种群,Evolution,Genomics,研究,Eastern,测序,基因组,cerana,群体
来源: https://www.cnblogs.com/djx571/p/11248428.html