理解单细胞数据的本质,一个matrix,以及行与列的annotation。
一个最不友好的格式就是loom,只能用python来读取,存储为CSV。
其次就是scanpy的adata,也需要特殊的python来导出到R。
project/scPipeline/public/Linnarsson_2020_developing_mouse_brain/getData_from_loom.ipynb
待续~
标签:monocle,loom,python,跨平台,scanpy,单细胞,CSV
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