加速基因测序进程,北鲲云高性能计算平台再发力
作者:互联网
人体细胞内的DNA组成了基因,而变化莫测的基因排序决定了生物遗传变异的特性。在生命科学领域的基础性研究就是人类基因组的研究,基因组图谱是研究人员的“新华词典”。任何时候,破解人类自身的基因密码才能够更好地开发促进人类健康,预防疾病的医疗方法,其应用前景是广阔的,能够带来的未来是美好的。
而基因的数量之庞大,基因结构之复杂,如何能有效地进行基因测序,同时满足海量的基因组序列的存储要求,成为制约基因技术发展的难题,也就成为制约生命科学领域前进的绊脚石。因此具有强大储存功能的高性能计算平台北鲲云的出现解决了这部分的困难。
在实验的过程中,主要包括GSsflx测序平台,Solexa Genome Analyzer测序平台和SOLiD测序平台,通过生物分子的测量,在使用后期软件对得到的数据进行处理,在和原始的海量数据进行匹配处理和分析,通过对于基因序列的同源性和相似性进行比对,分析,遗传分析等等,获得实验结果。
这就要求在处理数据的过程中,软件或者说平台具有强大的计算能力,以及足够对原始数据的存储空间,同时要满足大数据的更新需求。北鲲云超算平台通过对国内外六大主流公有云计算平台的整合,配合公司独家开发的计算调度模块,给用户提供一个“私有”的云端超算平台。
北鲲云超算平台提供从数据存储,软件供应,算力支持的流程化服务,有效地帮助生命科学领域研究人员做到管理大数据,存储现有数据,以及对新的基因序列组进行处理对比,分析的作用。
北鲲云超算平台还可以定制需求,面对不同的研究人员不同的计算需求,凭借对于云计算行业的深入了解,平台就预先安装了300多款软件,随时使用随时打开,无需下载。同时更丰富场景,深入了解生命科学领域基因技术的各个需求层面,搭建了从基因测序,标靶发现,虚拟筛选到分子动力等全部流程的研发环境。
除此之外作为高性能计算平台,北鲲云超算平台持续更新硬件资源,在价格上却和传统的超算平台持平,同时数据传输(HTTP网页/高速UDP传输客户端)可获得10倍加速,让用户降低使用成本的同时获得更好的服务。
同时北鲲云超算平台还建立了一支7X24小时的技术服务团队,30分钟之内可以响应客户,解决问题,给用户一流的使用体验。目前,北鲲云超算平台从技术上,服务上都是国内外的高性能计算提供商,但平台依旧在不断创新研发,为的就是给用户提供更快速,更便利,同时具有更多功能的超算平台,协助基因技术突破屏障,从而进一步推动生命科学研究的发展。
标签:测序,发力,平台,基因,生命科学,北鲲云,超算 来源: https://www.cnblogs.com/cloudam-1/p/15054881.html