Linux中root安装microsoft R open（MRO），普通用户如何使用？

年前，发现了Microsoft R Open更新到了4.0，就把服务器上的R版本更新了。

原来的版本：3.5.1

R version 3.5.1 (2018-07-02) -- "Feather Spray"Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)R是自由软件，不带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由散布。
用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。

R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献.用'contributors()'来看合作者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。

用'demo()'来看一些示范程序，用'help()'来阅读在线帮助文件，或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
用'q()'退出R.Microsoft R Open 3.5.1The enhanced R distribution from Microsoft
Microsoft packages Copyright (C) 2018 Microsoft Corporation

Using the Intel MKL for parallel mathematical computing (using 64 cores).Default CRAN mirror snapshot taken on 2018-08-01.See: https://mran.microsoft.com/.[原来保存的工作空间已还原]

现在root下已经安装过了MRO（Microsoft R Open）4.0.2，但是普通用户怎么安装呢？

上网搜索了一下，发现可以再非root用户下安装，有两种途径：

1，conda安装

conda install -c r r-microsoftr

但是版本还是3.5，忧伤，不是最新版的

2，解析install.sh的代码，

代码来源：https://www.jianshu.com/p/5958fa98d42f

# 1.下载并解压官方安装包
wget https://mran.blob.core.windows.net/install/mro/3.5.1/microsoft-r-open-3.5.1.tar.gz
tar -xf microsoft-r-open-3.5.1.tar.gz
cd microsoft-r-open/# 2. 查看 install.sh 内容
less install.sh
# 分析发现脚本判断了当前操作系统然后依次安装(以 YUM 为例)# ${SCRIPT_DIR}/rpm/microsoft-r-open-mro*.rpm
# ${SCRIPT_DIR}/rpm/microsoft-r-open-foreachiterators*.rpm
# ${SCRIPT_DIR}/rpm/microsoft-r-open-mkl*.rpm

# 3. 分别查看三个 rpm 包的安装脚本，重点看 postinstall scriptlet 部分的内容
rpm -qp --scripts rpm/microsoft-r-open-mro*.rpm
rpm -qp --scripts rpm/microsoft-r-open-foreachiterators*.rpm
rpm -qp --scripts rpm/microsoft-r-open-mkl*.rpm
# 分析发现 mro* 包是在往 /usr/bin/ 下面写链接文件
# foreachiterators* 没有做任何事情
# mkl* 备份了原有的 R/lib/*.so 文件，并拷贝了一套新的动态链接库文件覆盖到了安装路径中

# 4. 手工解压 rpm 包
rpm2cpio rpm/microsoft-r-open-mro*.rpm |cpio -idmv
rpm2cpio rpm/microsoft-r-open-foreachiterators*.rpm |cpio -idmv
rpm2cpio rpm/microsoft-r-open-mkl*.rpm |cpio -idmv

# 5. 手工执行 postinstall scriptlet
INSTALL_PREFIX="./opt/microsoft/ropen/3.5.1/" # 从前面解压的路径可以看出来
mkdir -p ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/backup/lib
mv ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/lib/*.so ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/backup/lib
cp ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/backup/lib/libR.so ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/lib
cp ${INSTALL_PREFIX}/stage/Linux/bin/x64/*.so ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/lib

# 6. 拷贝解压完的目录到指定安装位置
MRO_HOME="~/mro"
cp ${INSTALL_PREFIX} ${MRO_HOME}

# 7. 设置环境变量
# 注：R_HOME 会影响含 C++ 的 package 编译安装时寻找的头文件和链接库，详见 ${INSTALL_PREFIX}/lib64/R/etc/Makevars。
export R_HOME=${MRO_HOME}/lib64/R
export PATH=${MRO_HOME}/bin:${PATH}

上面应该可以成功，但是很复杂，我明明有root权限，为何不能直接用root下的R呢？

正确的方法

发现MRO安装的路径：

/opt/microsoft/ropen/4.0.2/lib64/R/bin

查看我自己的R路径：

$ which R~/anaconda3/bin/R

把我的R路径，建立软链到MRO的路径下即可！

cd ~/bin/ln -s /opt/microsoft/ropen/4.0.2/lib64/R/bin/R .

然后查看一下R的路径：

$ ll R
lrwxrwxrwx 1 dengfei dengfei 40 2月   8 13:17 R -> /opt/microsoft/ropen/4.0.2/lib64/R/bin/R

搞定！

测试一下：

$ R

R version 4.0.2 (2020-06-22) -- "Taking Off Again"Copyright (C) 2020 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)R是自由软件，不带任何担保。
在某些条件下你可以将其自由散布。
用'license()'或'licence()'来看散布的详细条件。

R是个合作计划，有许多人为之做出了贡献.用'contributors()'来看合作者的详细情况
用'citation()'会告诉你如何在出版物中正确地引用R或R程序包。

用'demo()'来看一些示范程序，用'help()'来阅读在线帮助文件，或
用'help.start()'通过HTML浏览器来看帮助文件。
用'q()'退出R.Microsoft R Open 4.0.2The enhanced R distribution from Microsoft
Microsoft packages Copyright (C) 2020 Microsoft Corporation

Using the Intel MKL for parallel mathematical computing (using 64 cores).Default CRAN mirror snapshot taken on 2020-07-16.See: https://mran.microsoft.com/.[原来保存的工作空间已还原]

测试一下radian：

$ r
R version 4.0.2 (2020-06-22) -- "Taking Off Again"Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)r$>

完美！

标签：INSTALL,open,Microsoft,MRO,rpm,lib64,root,microsoft
来源： https://blog.51cto.com/u_15242286/2843996