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Python:如何在未排序的列表中查找大于某个数字的所有项(大数据集)

作者:互联网

尽管如此,其他人也曾提出过类似的问题. here,但他们略有不同,并没有真正解决我的问题,所以我再来一次.

我有N个列表(N> 20,000),每个列表包含M个列表(M> 20,000),方式如下(数据为虚拟):

Key1: [ [4,3,1], [5,1,0] ...... [43,21,0 ] ]   # List 1 with collection of M smaller lists
:
:
KeyN: [ [5,4,1], [55,1,1] ...... [ 221, 0, 0] ] # Nth list

数据未分类.逐个迭代一个阈值列表,比如阈值= [2,3,5,7,8],其中阈值应用于中间元素,我想提取所有键的所有元素,大于门槛值.对于前者根据我上面写的数据,Threshold = 2会产生

 For Key1: [ [4,3,1], [43,21,0]]
 :
 : 
 For KeyN: [[5,4,1]]

同样对于其他阈值也是如此.由于列表太多,我的观察是排序会导致很多开销,因此我想避免它.在python中执行此操作的最佳方法是什么?另外一个重点是,我自己构建数据,因此可能有一个更好的数据结构来存储数据.我目前将数据以PersistentList的形式存储在ZODB的Btree容器中,建议使用here.以下是用于它的代码片段:

for Gnodes in G.nodes():      # Gnodes iterates over N values 
    Gvalue = someoperation(Gnodes)
    for Hnodes in H.nodes():  # Hnodes iterates over N values 
        Hvalue =someoperation(Hnodes,Gnodes)
        score = SomeOperation on (Gvalue,Hvalue)
        btree_container.setdefault(Gnodes, PersistentList()).append([Hnodes, score, -1 ])
    transaction.savepoint(True)  
transaction.commit()

关于什么应该是最有效的方法的任何建议?排序第一的确是最佳方式吗?

解决方法:

使用生成器理解:

(sublist for sublist in Key1 if sublist[1] > Threshold)

生成器只按需计算元素,因为它按顺序遍历列表的元素,所以不需要排序. (也就是说,它在每个Keyn的长度上以线性时间运行,而不是用于排序的M * log(M).)

等效地,在函数式中(仅在Python 3中等效;对于Python 2,使用itertools.ifilter):

filter(lambda sublist: sublist[1] > Threshold, Key1)

如果您的Keyn列表存储在列表(或其他可订阅对象)中,您可以一次处理它们(显示一些替代样式):

filtered_Keys = [(sublist for sublist in Key if sublist[1] > Threshold)
    for Key in Keys
]

要么

filtered_Keys = list(map(
    lambda Key: filter(lambda sublist: sublist[1] > Threshold, Key1),
    Keys
))

此方法相对于排序的性能

此方法是否比排序更快取决于M和您拥有的阈值T的数量.运行时间(对于每个键列表)是O(M * T).如果您对列表进行排序(O(M * log(M))),则可以对每个阈值使用二进制搜索,总运行时间为O(M * log(M)T * log(M))= O (max(M,T)* log(M)).当T相对于M足够大时,排序更快.我们无法先验地知道常数,因此测试两种方式以确定在给定数据的情况下是否更快.

如果两者都不够快,请考虑编写自己的线性时间排序.例如,radix sort can be generalized to work on (non-negative) floats.如果你真的关心这里的性能,你可能不得不把它写成C或Cython扩展.

标签:zodb,python,sorting,search
来源: https://codeday.me/bug/20190902/1787696.html