PYTHON h5py库包安装及读写
作者:互联网
一、h5py库包安装
1. 在线安装
基本方法:
cmd
安装:pip install h5py
pycharm
环境:file-->setting-->PROJECT-->Project interpreter-->**+**-->搜索需要的库包-->installing
然而,本人在线安装该库包时报错,猜测可能原因是依赖环境下载问题,于是下载相应库包并手动安装:
2. 离线安装
2.1 登录PYPI网站下载所需库包
网址:https://pypi.org/
搜索h5py
库包和相应的依赖库包six
库包,下载对应python版本及个人计算机的库包
ATTENTION:在python中安装h5py库包需要的依赖条件:six库包,我们要同时下载该库包,先安装之
2.2 cmd安装下载的whl文件
以windows 64位系统+python3.6环境为例:
下载了h5py-2.10.0-cp36-cp36m-win_amd64.whl
和six-1.14.0-py2.py3-none-any.whl
二库包
- 打开cmd窗口,转到下载的库包位置:
cd D:\\支持环境软件\python包
- 先安装依赖环境,输入命令
pip install six-1.14.0-py2.py3-none-any.whl
- 安装h5py库包,输入命令
pip install h5py-2.10.0-cp36-cp36m-win_amd64.whl
OK!
二、h5py基本操作
1. HDF/h5文件基本构成
可以将h5文件理解成文件夹系统,group
就是文件夹,dataset
就是文件。
group里面可以存储group以及dataset。
2. 写——利用h5py库包创建h5文件及其group和dataset
import numpy as np
import h5py
2.1 创建一个h5文件,文件指针是f
f = h5py.File('HDF5_FILE.h5','a')
创建模式:
r Readonly, file must exist,仅读,文件必须已经存在
r+ Read/write, file must exist,读写,文件必须已经存在
w Create file, truncate if exists,新建文件,如果存在则覆盖
w- or x Create file, fail if exists,新建文件,如果存在则新建失败
a Read/write if exists, create otherwise (default),如果文件存在则读写,如果不存在则覆盖
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
2.2 对创建的h5文件创建其group和dataset:
假设我要创建3个group:Information、Data_group、Data_parameter
g1 = f.create_group("Information")
g2 = f.create_group("Data_group")
g3 = f.create_group("Data_parameter")
在Information组里面创建数据集:
a. 数据为numpy格式:
Inf_Data = np.array([[67.5,1],[350,4],[6.70,4.9],[10,58.4],[12000,97]])
d1 = g1.create_dataset('Spectrum_Resolution', data=SpeReData)
添加attribute:
d1.attrs['col1'] = 'Center Length'
d1.attrs['unit'] = 'm'
b. 数据为str数组:
dt = h5py.special_dtype(vlen=str) # 计划创建的数据格式是str
data = np.array([['slavery'],['kmi']])
d1 = g1.create_dataset('Slavery', data.shape, dtype=dt)
d1[:] = data
3. 读——获取h5文件各group和dataset信息
稍后发布
4. 批量读写
5. 整体代码
标签:group,PYTHON,dataset,h5py,h5,安装,库包 来源: https://blog.csdn.net/weixin_45337440/article/details/118518016